一个古怪的机器从海中出现，吞食了萨克松。原来这台机器就属于传说中的恐怖组织神像联合体。他们把萨克松带到了一个进行了电磁屏蔽的机库，在机库里，神像联合体的成员鲍威尔(Powell)和凯尔索(Kelso，萨克松在行动中放跑的女“平民”，前美国特工)、黑客D-Bar与萨克松一起登入了杀戮间，并获悉暴君小队将要前往瑞士的日内瓦。而与此同时，著名的反生化器官改造的组织人权前线(Humanity Front)的领袖比尔·塔咖特( Bill Taggart ，游戏中这个大叔将会多次出现)也将到达日内瓦。暴君小队计划在塔咖特到达万国宫时将其刺杀，进而将他塑造成为反生化器官改造运动的烈士，以此推动联合国对生化器官改造的限制。

　　为了阻止暴君小队的行动，萨克松和神像联合体的成员们动身前往日内瓦。萨克松和鲍威尔带队袭击暴君小队的飞行器，而其他诸人则负责阻止一个将被用于袭击塔咖特的自爆汽车。萨克松等人在飞行器上发现了暴君小队的第三个基地“伊卡洛斯”，却在随后的爆炸中几乎被全灭。在最后关头逃生的萨克松通过无线电警告凯尔索行动已经暴露，却听到了纳米尔的声音。纳米尔威胁说他已经把凯尔索挟持为人质，如果萨克松不在大庭广众下杀死塔咖特，那他就会杀死凯尔索。萨克松不愿意让无辜的凯尔索送命，只得奉命前往万国宫。

　　在途中，哈德斯给了萨克松只装了一颗子弹的左轮手枪，并再度警告萨克松：如果萨克松不奉命行事，巴雷特就会在视频网上现场直播虐杀凯尔索的全部过程。萨克松一路击败了钟楼联合公司的护卫，却在最后的关头拉开了塔咖特，让塔咖特躲过了哈德斯的狙击。塔咖特早就知道启示会的存在，他质问萨克松是否是“他们”派来的杀手。但萨克松却无暇顾及塔咖特，他直奔图书馆，并用仅有的一颗子弹射落吊灯，困住了潜伏在那里的哈德斯。在2人的格斗中，哈德斯用自己的生化手臂击伤了萨克松，但萨克松最后把哈德斯的武器捅进了哈德斯的颅腔，结果了他的性命。

　　日内瓦警方开始追缉萨克松，负伤却又孤立无援的他只得向雅努斯求助。雅努斯告诉他所谓的“伊卡洛斯基地”实际上就是罗纳河上的一艘游艇，凯尔索就被关押在上面。萨克松挟持暴君小队的垂直起降飞行器登上了伊卡洛斯基地，提出要在一对一的战斗中结果纳米尔，从而解决两人之间的恩怨。在装备了更先进的生化器官的纳米尔面前，萨克松胜算渺茫，但他利用一把10毫米手枪出奇争胜，制服了纳米尔。随后，萨克松用纳米尔交换了凯尔索，并带着凯尔索跳下了燃烧着的伊卡洛斯。由于警方赶到，暴君小队乘坐飞行器离去，以为萨克松2人必然会被烧死。但事实上，凯尔索的生化呼吸器能在水下工作，她和凯尔索通过船体上的破洞成功逃生。

　　最后，凯尔索把雅努斯的预言告诉了萨克松——一场剧变即将降临，没有任何人可以改变这个事实。

　　亚当·杰森的故事

　　——《杀出重围——人类革命》

　　亚当·杰森不是什么单纯的“前SWAT特警”，生于1993年的他实际上是一个军事科研项目的产物，被VersaLife公司(这个系列中的幕后黑手之一)的子公司White Helix用于测试基因治疗手段。在研究过程中，与他同一批诞生的婴儿都按计划死于各种试验，只有发生了基因变异的亚当存货了下来。面对大量死亡的婴儿，他的父母无法继续研究，为了避免将来有更多的孩子受害，他们选择焚毁了White Helix试验室，自己也一并葬身其中。而幸运的亚当则被一名善良的员工米歇尔·沃尔特(Michelle Walthers)救出了火海。

　　后来，同样爱心爆棚的杰森夫妇领养了亚当，这个基因变异的小孩改名为亚当·杰森，过上了正常人的生活，甚至还在凤凰城大学拿了个司法正义学的副学士学位。在他21岁的时候，杰森加入了底特律警局，并在工作4年后加入了底特律警局SWAT小组，由昆西·杜兰特(Quincy Durant)指挥。

　　毫无疑问，杜兰特曾经是杰森的良师益友，但是在2021年一次制止改造人犯罪的行动中，杜兰特失去了右臂，还险些丧命。生化器官改造技术挽救了杜兰特的生命，但却在暗中对他的精神状态构成了及其不利的影响。杜兰特开始以杀戮为乐，在接下来的四年里，他的小队几乎将底特律的半数犯罪团伙残杀殆尽。

　　2025年，杜兰特的小队在底特律的墨西哥城(Mexicantown)引起了一场骚乱，这场骚乱后来被称为墨西哥城大屠杀(Mexicantown Massacre)。杰森在这次战斗中用EMP手雷击败了杜兰特，可是后来发生的事情却让他最终选择离开了警队——上级命令杰森射杀一个接受过人体改造的少年嫌犯，但杰森却不愿执行这种命令。他的队长韦恩斯·哈斯( Wayne Haas)替杰森射杀了那个少年，却因舆论的责难被革职，被安排到警局当门房。心灰意冷的杰森也从此投身私人保安业务，开始为萨里夫工业公司效力，成为了商业巨头大卫·萨里夫(David sarif)的私人安全顾问。

　　但事实上，杰森对萨里夫工业公司的意义远远不止一个经验丰富的安全顾问。萨里夫早就派私家侦探布伦特·拉德福德(Brent Radford)查清了杰森从出生到加入萨里夫工业公司的一切底细。杰森的特殊基因对人体改造用的生化器官没有排斥反应，换句话说，杰森不需要排斥反应抑制药剂(Neuropozyne)就可以移植生化器官。杰森的女友梅根(Megan)正背着杰森研究他的基因样本，把杰森看做通向更先进的生化器官改造技术之门的圣柜。杰森自己就是在游戏开始时能看到的那个所谓的“病人X”(Patient X)。

　　2027年，当萨里夫工业公司的一系列研究进入关键阶段，众人准备前往首都华盛顿为政府众高官介绍研究进展的时候，暴君小队带着一群雇佣兵袭击了萨里夫工业公司，破坏了绝大部分与生化器官改造有关的研究设施，杀死了一批关键的研究人员。杰森也被纳米尔打得毫无还手之力，几乎命丧当场。为了挽救杰森的生命，萨里夫下令对杰森进行全身性的生化器官改造，杰森里里外外几乎被换了个遍。为了适应生化器官改造的影响，杰森休息了六个月。

　　当然，杰森不可能一直这么闲着。一个极度抵制生化器官改造的纯人类激进组织“纯人类至上”(Purity First)在泽克·桑德斯(Zeke Sanders)的指挥下袭击了萨里夫工业公司的一个试验室，而当晚台风式爆炸攻击系统恰好要在那个试验室进行试验。萨里夫要求杰森在SWAT干预之前进入试验室，保证台风系统的安全，同时营救人质。

　　杰森顺利地完成了任务，但在任务的执行过程中，他得到了一个有趣的发现——试图盗取台风系统信息的黑客是一名改造人，一个出现在纯人类激进组织“纯人类至上”中的改造人。更有趣的是，在与激进者头目桑德斯对峙的时候，杰森发现桑德斯对那个改造人黑客一无所知。

　　整个事件完全是个阴谋：有人利用“纯人类至上”组织袭击试验室的机会盗取数据，并鼓励桑德斯挟持人质。这样，幕后黑手会得到数据，而知道他身份的桑德斯等人却会因为挟持人质而被强硬的警方杀死，进而掩盖一切证据。杰森向桑德斯解释了这其中的诡计，救出了人质。而后他放走了桑德斯，希望桑德斯能帮他找出幕后黑手。

　　在面见了萨里夫之后，2人发现底特律警方也在试图掩盖袭击的真相，杰森只得再闯警局。在警局的停尸间里，他从黑客的头部取出了一个用于遥控的生化器官，获知这名黑客也是一个被操纵的工具，操作他的人叫做艾瑞·范·布伦格(Arie Van Bruggen)。随后的调查把杰森引向了高地公园，并让他无意发现了暴君小队的踪迹。他尾随暴君小队进入了联邦紧急状态局(FEMA)的一个营地，并在那儿与暴君小队的成员巴雷特进行了一番激战。通过审问巴雷特，杰森得知袭击萨里夫工业公司并非FEMA指使，幕后黑手另有其人——这个人隐藏在上海的横沙(Hengsha)。

　　在杰森前往上海之前，萨里夫告诉他梅根等人的死并不是因为有人想要阻止台风系统或是别的什么军用生化器官的开发，而是有人担心梅根的研究小组将会改变人类的进化路线。

　　在上海，杰森获悉钟楼联合公司的保安部队封锁了布伦格的公寓，布伦格下落不明，也许正在逃避钟楼公司部队的追杀。杰森只得转而与当地的地下社团合作，并从社团头目童四洪(Tong Si Hung)口中得知布伦格被他们藏在了爱丽丝胶囊公寓。出乎意料的是，布伦格毫不隐瞒自己的动机，他告诉杰森自己是在泰永制药公司(Tai Yong Medical)的老板赵云茹(Zhao Yun Ru)的指使下对萨里夫的公司进行了袭击，而泰永制药原本就是萨里夫工业公司的对头。为了防备赵云茹的暗算，布伦格把交易的证据藏在了位于横沙上层的泰永制药巨塔当中。眼看赵云茹派来灭口的部队就要杀到门前，布伦格积极主动地帮杰森混入了连接横沙下层与泰永巨塔的建筑——盘古(Pangu)

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