【远古的战争】
在远古时代，仙界只有少数法力高强的天神，如九天玄女之类，他们是这个世界上的第一批神仙。他们经常现身在人间，指引人类的发展。人类此时仍然处于部落联盟状态，彼此征战不休。而这个时期的妖魔，出于各自不同的嗜好和利益，或是在人类聚居区为害一方，或是平静地生活在人烟稀少处，还有一部分作为人类的盟友则属于各个部落联盟。
经过长期战乱，曾经被视为中原部落之首的炎帝部落逐渐衰弱，而在东夷的土地上，一个以妖魔为主的部落——九黎，在他们英明睿智的大酋长蚩尤的率领下终于统一了绝大部分东夷部落，成立了天下最强大的部落联盟。无可避免的，九黎的目光落到了中原的土地上，炎帝部落虽竭力抵抗，最终还是被驱逐出了中原。看上去九黎族即将成为新的主人。
但是被九黎打败的炎帝部落并没有放弃，他们与北方的黄帝部落成功结盟，共同对抗九黎的威胁。双方在古老的土地上进行了连番大战，由于九黎在助战妖魔方面占有绝对优势，炎黄联军虽然英勇奋战，却仍然不是九黎虎狼之师的对手，处境岌岌可危。在这紧急的关头，黄帝终于在与天神的沟通上取得了成功，在最后的涿鹿战场上，炎黄联军在天神的帮助下取得了决定性的胜利。九黎族酋长蚩尤战死、将领们或是被杀，或是投降。胜利者将蚩尤的尸体分为六份，封印在不同的位置；九黎族的主要成员被驱逐出三界之外，大批为九黎军作战的妖魔被处以严厉的惩罚。和平到来了，然而人仙魔和谐共处的时代过去了。
【战争的影响】
涿鹿之战后，上古天神派出代表，与炎黄部落的著名英雄以及投降的九黎英雄组成了最初的天庭。天庭的职责是保卫三界的安全、维护三界的稳定，但是尽量避免干涉三界的自然发展。炎黄以及九黎英雄们由凡人或妖魔成为神仙的仪式，被称为封神。天庭成立初期，人世间的战争导致了相当多仙人的陨落，为了填补他们留下的空白，封神仪式也进行了好几次。然而随着天庭进一步严格执行不许干涉人间事务的戒律，神仙的位置也逐渐变得稳固，只有极少数的凡人能够成功得道升仙。
打败九黎的胜利并没有给人间带来长久的和平，涿鹿之战不久，炎黄二帝就因为权力之争开始了内战。黄帝在这场斗争中获胜，并且宽容地对待了失败者，由此成为了独一无二的领导人。从此炎黄部落逐渐融合在一起，成为后来中华民族共同的祖先。
在远古的那场战争中，受伤最深的也许是妖魔一族。力量上的先天优势使得妖魔成为双方阵营的主力军队，但也因此在长久的战事中损失惨重。战争结束后，为了保证人类在凡间的生存优势，属于炎黄阵营的强大妖魔们被安置在了天庭成为护法仙兽，而属于九黎阵营的强大妖魔或是被封印，或是被安置在无法直接连通凡间的魔界。只有力量较弱的妖魔才允许继续生活在人界。当然，总会有一些漏网之鱼成功躲过了这次大迁徙，继续躲在秘密的角落。
【现在的三界】
由于故意的疏离，几千年过去后，天界和魔界都已经化作了传说故事。而在人界，人类和妖魔的力量似乎达成了一种动态的平衡：人世间太平盛世时，妖魔们大多蛰伏于山林；人间战乱动荡时，各色妖魔也会出来兴风作浪。
大唐贞观年间，经历了隋末的战乱，中原处于百废待兴的关键时期，然而西南的吐蕃、西方的吐谷浑、西北的突厥、北方的薛延陀、东北的高句丽，都对中土大唐产生严重的威胁。内忧外患之中，唐皇李世民引导着大唐艰辛的从大乱向大治迈进。然而，战乱中壮大起来的邪魔外道不甘心重新被压制，它们利用各种方法祸害百姓，蛊惑人心，试图让中土重新回到混乱之中。
天界和佛界的神佛注视着人间的变化，但是却不能直接插手干预。在观音大士的提议下，一支由善良的得道高僧、神通广大的妖猴以及三位被贬谪的仙人组成的取经团队被组织起来，目的是前往西方佛祖处取得大乘真经，带回中土普度世人、安抚人心。这支队伍的成员以各种不同的方式降生在人世间，他们没有想到，除了一路上的山精野怪，他们还需要面对一股更加邪恶的势力。
【九黎的复苏】
几千年前胜利者利用各种措施削弱和隔离九黎族的时候，一定没有想到他们还会有卷土重来的一天。随着岁月流逝，将蚩尤的尸体分开封印的方式并没能阻止蚩尤灵魂的复生。在蚩尤强大的灵魂力量作用下，被放逐到异界的九黎族人渐渐通过神秘的传送门回到了三界，他们蛰伏在寒冰宫的深处，计划着复仇和复兴。而这个计划的第一步就是阻止西天取经的队伍、让人间保持混乱。
一位被称为“无面”的神秘人士，被授权指挥破坏取经事业的行动，他使用各种手段扭曲了五位取经人的命运，使他们偏离自己命中注定的轨道，但是他的计划被三界的侠客们所破坏，五位取经人最终还是走上了去西天取经的道路。无面不得不改变原先的部署，改为与取经途中的妖魔合作，试图将取经队伍扼杀在半道上。不过无面的计划依然不断遭遇失败，三界的侠客们通过破坏这些计划，逐步发现了隐藏在黑幕之后的九黎族。大唐帝国在西北的军事胜利，更是导致了寒冰宫这一九黎秘密基地被发现。
【新的阴云】
九黎族对于当代的人们来说只是一个未知的敌人，但天庭却如临大敌，他们向寒冰宫派出的大批斥候受到了九黎妖魔的无情杀戮。重见天日的九黎族甚至敢于不断组织针对大唐都城长安的远征。天庭意识到：必须集结三界的全部力量，才能对抗九黎的入侵。
与贞观初年相比，此时的人间已经逐渐恢复了元气，人们开始安居乐业，建设自己的家园。三界的侠客们也都拥有了自己的幸福人生。但是，面对着新的战争阴云，我们的英雄们不得不升级自己的装备，跨上自己的坐骑，离开美丽的庭院，再次踏上战场。