原本“魔力宝贝”故事的背景为“法兰王国”和其周围的诸国为舞台来展开故事，但在“乐园之卵”中，主要的舞台则以崩坏后四千年后的未来世界为主。

　　而另外一个游戏关键点为“卵”。“时之卵”、“精灵之卵”、接著“乐园之卵”。这些东西对故事情节和系统，都有相当大的关联性。

　　“世间所有将合而为一，并且重生”

　　从卵中诞生的究竟是何物……？这就要交由智勇双全的勇者们，亲自探索其中的奥秘了。

　　勇者们经历了一连串的征战后，最后到了与最终魔王“李贝留斯”决战的重要时刻，激战的过程，是前所未见的震撼与伤亡…，李贝留斯被击败之时，吩咐部属破坏了龙之沙漏的精密零件，而导致时空交错的情况发生，正在此时的法兰城，即被突然其来的陨石给击中，顿时间，整个法兰城内烟雾弥漫，究竟发生了甚么事情，也没有人知道。

　　事后，法兰城内陆续冒出了从未出现的怪物，法兰国王见事态严重，紧急公开招募勇者们，前往事发地点勘查，并消灭这些难缠的怪物，幸好，此次的事发地点在“里谢里雅堡”西边花园，对于百姓的生活，较无太大的影响，于是勇者们协同义勇军封锁了这个区域。法兰国王为了确认此陨石造成的危害，派遣王宫学者、贤者前往了解状况，过了数小时后，才发现原来此陨石为目前龙之沙漏残缺的一小部份，也因为龙之沙漏的每个精密零件，都具有时空连接的神秘力量，因此，此时已经被连接到某个不知名的时空了。

　　另外，魔力宝贝的构成与四大元素“地、水、火、风”，有相当密切的关联性，因此制作团队将变身的极限，与四大元素结合后，成为一种“出神型态”的能力提升，而在视觉上的表现，更别于魔力宝贝 ver3.0 时的视觉感，不但特别强调精灵变身后的呈现模样，更在整个色彩表现上，突破原有的极限！从原有的整体画面 256 色的型态，转换为单一元件可独立表现最佳化 256 色，整体则可达到全彩的模式，因此，在 ver4.0 开始，过去部分呈现网点的形式，将以更细腻的方式来成象，对于重视视觉感官的玩家，更是一大福音！玩家在游戏画面上，将可看到如同“元素流动”般的特效。

　　“精灵变身”是透过消耗“爆发值”(※爆发值如同打卡时间一样，会慢慢消耗！)，并一个在限制时间内，使角色能力强化的系统，但精灵变身的效果，会依照职业类别的不同，而有所差异。但是要使用精灵变身时，需要装备变身强化的道具，才会增加一个“精灵变身”的选项，然后使用“爆发值”来变身。

　　虽然精灵变身看似属于战斗系职业所使用的系统，其实各种职业都是可以使用的，但是首要的条件就是取得“精灵变身”的道具，这些道具将可在精灵神殿中取得。精灵神殿共有四个属性，即是“地、水、火、风”四大属性，不同的属性神殿中，亦有不同的困难任务，守卫著这些神秘的“精灵之卵”。

战斗中的精灵变身
攻击力UP
耐久力UP
魔法效果UP
属性效果UP
使用“精灵变身”之第一回合，通常不会受到第一次攻击。
于“精灵变身”之后第二回，若于战斗回合中未受到攻击时，“精灵变身”将会被解除。

生产、采集之精灵变身
更可以制作出数值优秀之道具。
可以制作等级1以上的东西。
回复等，会提高回复量。

精灵变身等级
精灵变身的等级依“精灵之卵”的等级来决定，等级高的“精灵变身”虽能发挥较高的效果，但所消耗的燃烧点数也较高。
简单来说，就是“低等级→爆发值低消费、低 Power；高等级→爆发值高消费、高 Power”。

　　另外，在4.0的场景中，也加入了许多的动态背景效果，例如像是“水晶光芒、流水、星空、瀑布…等等”，都彻底表现了场景的气氛，许多场景的设定，在未来势必成为更多玩家的“约会地点”，某些区域，也有“动人的鸟叫声、虫鸣、流水声、风声…等等”，更容易使得玩家融入其中。

○ 全新的各栏位显示方式
1. 角色资料现在除了数值显示之外，还增加显示基本数值的图表。
2. 增加了公会专用的系统介面，不过最主要的功能部分，还是以公会房间内的设备为主，其介面上属于较简单的联络方式。
3. 时间、目前角色状态的显示，包含“爆发值”剩余时间的部分，已经改由萤幕左上方直接显示。
4. 对话文字的显示，现在改为透明视窗，并且可直接在画面上修改“行数、说话范围、字体大小”，另外，在角色头顶上方，也会出现玩家所说的话。

　　整体上都有相当大的改变，除了从原先的网点显示，变成视窗透明外，最主要就是强调“随性、便利、操作性高”三大理念来修正过去不便的介面，无论新手、老手玩家都会相当满意这样的改变。