1999年：《莎木》(其他作品：《生化危机：代号维罗尼卡》、《完美黑暗》、《黑与白》)

　　1999年的E3隐约又有着“山雨欲来风满楼”的趋势，几大厂商纷纷提前预告自己新主机的存在，索尼的PS2，任天堂的“海豚”(后来的NGC)，连微软都颇有些意外地宣布Xbox计划首次插足主机市场，不过率先作出行动的还是全力做最后一搏的世嘉。

莎木

　　当年的E3展上，世嘉宣布新主机DC美版于99年9月9日发售，游戏阵容也是空前绝后最豪华的一次，除了原创大作《索尼克大冒险》外，还有《世嘉拉力2》《VR战士3》《死亡之屋2》等完美移植的街机大作，《生化危机：代号维罗尼卡》，《魂之利刃》等第三方作品同样惊艳，不过公认最精彩的部分还是号称全新游戏概念的《莎木》的亮相，对比后来沙盒游戏的盛世，更让人感叹这款游戏或许生错了时代提前到来。

　　而由游戏批评家大奖所选出的最佳主机游戏则是任天堂N64时期的名作《完美黑暗》、PC游戏则是EA出品，牛娃工作室创始人Peter Molyneux的新作《黑与白》。

　　2000年：《合金装备2》(其他作品：《鬼武者》、《最终幻想9》、《街头喷射小子》)

　　2000年E3的主题为“超越想象”，而在PS2已经正式发售的情况下，索尼表现出了席卷天下的气势，要以强大的游戏阵容扫平一切阻挡在它前面的对手。《鬼武者》、《保镖》、《黑云》等一批PS2新作蓄势待发，PS的游戏阵容更是余威不减，《最终幻想9》、《勇者斗恶龙VII》、《恐龙危机2》、《寄生前夜2》等一批系列作品都赫然在列。

合金装备2

　　不过在当年的现场，没有一款游戏能和《合金装备2》引爆的气氛相比，和初代用即时演算的画面震惊全场那时一样，只是这次在PS2上的效果更加惊人，证明了游戏完全可以不输给电影，以大片的方式来呈现艺术，长达10分钟的MGS2预告片搭配气势磅礴的音乐赢得一片喝彩，同时也是展示PS2机能的最佳游戏。

　　比较之下，其他几家厂商都没有太多新动向，世嘉DC上的《街头喷射小子》有些意外的获得游戏批评家大奖最佳主机游戏，《黑与白》则蝉联PC部门。

　　2001年：《GT赛车3》(其他作品：《最终幻想10》、《寂静岭2》、《生化危机0》)

　　2001年的E3上微软正式宣布Xbox将于11月8日发售，取代世嘉成为新的主机三巨头，与此同时任天堂不甘示弱的表示NGC将于三天前首发，两家对打擂台的结果就是各自公布了一批新游戏，任天堂自然还是旗下一批马里奥为首的老品牌，移师NGC的《生化危机0》也格外引人注目，微软则是接收了大量的世嘉资源，同时不少第三方表示有意加入并推出独占作。

GT赛车3

　　不过这一年整体的赢家依然是索尼和PS2，在北美发售后取得了巨大的成功，到E3展时已经卖出了300多万台，全球销量更是突破了1000万台，索尼也开始更加注重所谓的大作，《合金装备2》继续大出风头，而具有强烈真实感的《寂静岭2》、究极华丽的《最终幻想10》、以及由《GT赛车2000》进化而来，号称史上最真实赛车游戏的《GT赛车3》等都让人们见识到PS2游戏所应该具备的水准，《GT赛车3》更是在后来成为PS2第一个千万销量的游戏。

　　2001年游戏批评家大奖将最佳主机游戏留给了《合金装备2》，PC部门则是《无冬之夜》表现出众，之后连续三年获得最佳RPG游戏。

　　2002年：《塞尔达传说：风之杖》(其他作品：《忍者龙剑传》、《虚幻竞技场》、《毁灭战士3》)

　　2002年E3开幕前，索尼就自豪地宣称主机大战已经分出胜负，PS2是最大赢家，从实际结果来说也绝不夸张，本次E3上PS2的游戏阵容同样包罗万象，而且后来PS2销量最高的两款游戏，GTA系列也在此时崛起并宣布两年内由索尼独占。

塞尔达传说：风之杖

　　不过在E3期间，微软和任天堂的表现都不逊色，一方面微软打着长远之计，并不急于在这一代就取得天下而是站稳脚跟，凭借家底慢慢攀升，微软在本届E3上的重点是Xbox的网络服务“Xbox Live”，另外《忍者龙剑传》等更多Xbox游戏的出现也意味着Xbox在发挥自己的优势努力吸引那些同一喜好的玩家。

　　而游戏批评家大奖最终把当年E3的最佳游戏留给了任天堂NGC上的《塞尔达传说：风之杖》，这款Fami通满分作品也不负盛名，称得上系列巅峰之作。而第一人称射击游戏《毁灭战士3》则异军突起，获得了PC部门的多个奖项，同时也为这一类型带来更多的影响。

　　2003年：《光环2》(其他作品：《合金装备3》、《GT赛车4》、《半条命2》)

　　2003年的E3演变为两巨头索尼和微软的对决，任天堂显得光芒暗淡，新上任的社长岩田聪未能挽回NGC的颓势。而游戏方面PS2继续大作不断，《合金装备3：食蛇者》和《GT赛车4》两大巨头的亮相让现场一片掌声，对PS2的未来更是信心十足。

光环2

　　尽管初代Xbox或许无法和PS2相比，但当届E3上微软的表现却并不逊色，游戏方面压轴戏的《光环2》最终成为最大赢家，长达8分钟的实际游戏演示录像充分显示了这款巨作的魅力，在《毁灭战士3》宣布移植Xbox后又有一款顶级的FPS大作吸引玩家，《光环2》也获得了游戏批评家大奖最佳主机游戏并在下一年蝉联——这也是98年以来的唯一一次。而获得最佳PC游戏的同样是一款经典FPS系列的最新续作《半条命2》。