我们的主角再次回到大马士革，在这里追击他的下一个目标：大商人阿布尔。阿泰尔潜入进阿布尔的宫殿，看到他讽刺着这场战争，并毒死支持萨拉丁的客人们一幕后，把这位肥肥的商贾之王当成了干草堆，从屋顶一跃而下，击杀成功。随后阿泰尔穿过惊恐的人群，甩掉追击的士兵，回到了马斯亚夫。
阿布尔：“你取走许多男男女女的性命，深信除去他们可以为这个世界带来和平；这是为了伟大目标所做的微小之恶，我们的行为并无二致。我们会迎来我们的新世界……”
威廉，阿卡的摄政王，同时也是狮心王理查的手下。阿泰尔经过一番调查，找到了威廉的所在地。于城堡门口，他正好赶上威廉护送狮心王出征。狮心王讽刺埋怨威廉处死了三千名本应交换俘虏的囚犯，这种行为只会让敌人怒火中烧，战力和意志变得更加旺盛。于是威廉与狮心王争吵起来，理查继续讽刺对方，并认为他践踏了圣战的荣耀。在狮心王走后，威廉自语新世界没有这种人的位置。然后阿泰尔潜入城堡，结果了威廉。他托着这位濒死的侯爵，指认他酝酿着谋杀狮心王的计划。而威廉临死前都坚信自己所做的是为全世界造福。
名单上的第六个目标是耶路撒冷的马吉德·阿丁，当地的私法制裁者。这令阿泰尔些许头疼，因为要再次面对看他不顺眼的马利克。不过此时的阿泰尔，已渐渐褪去轻狂的外衣，也变得更加谦卑，经历了几次任务的洗礼，他对刺客的信条有了更深的理解。第二次会面，马利克依然态度恶劣，并拒绝提供更多资源帮助阿泰尔完成任务。但阿泰尔依旧感谢了对方，并独自刺杀成功马吉德。在他完成任务返回马利克处时，他发现后者对他的态度虽然依旧不好，但已有了些许改变。
呆死萌从阿尼玛死中醒来，露西偷偷告诉他，阿布斯泰戈就是甜不辣的企业，并非简单的制药公司。而他的祖先阿泰尔从中世纪开始的抗争，至今并未结束。此时的呆死萌才意识到原来父母的话都是真的。露西认为，圣殿骑士的目标是好的，但为了达成目的而采用的手段的确相当糟糕。
呆死萌再次回到中世纪。随着任务进行，越来越多的疑惑萦绕阿泰尔的心头。于是他返回马斯亚夫，向慕瓦林询问这些目标之间的联系。导师告诉他，九个人都是圣殿骑士，而当初从所罗门神殿中夺回的宝物——伊甸碎片，具有蛊惑人心的力量。慕瓦林向阿泰尔详细讲述了伊甸碎片的作用，它曾经把木棍变成毒蛇，驱逐了亚当和夏娃；它令摩西分开红海；艾瑞斯用它点燃了特洛伊的战火；耶稣则用它让水变成了酒。如今，圣殿骑士们希望得到它，达到统治圣地的目的。只要他们的同伙还存活着，圣殿骑士就会不断尝试夺取此物。因此，必须把这些人杀光。阿泰尔听罢，若有所思地踏上下一阶段旅程。
第七个目标，条顿骑士团大师席班德受命到达阿卡。阿泰尔的刺杀已经引起了圣地的甜不辣们的警觉，席班德正是为了追查凶手而来。阿泰尔拍马赶到，看到席班德误把一名学生当成刺客杀掉了。他暗中尾随，结果了这位骑士团团长。
然后他再次来到大马士革，此地的大学者哈基姆正在进行焚书运动。这位首席学者被一大帮追随者簇拥，令阿泰尔很难下手。他获取了足够的情报后，轻松干掉了此人。
名单上只剩下圣殿骑士团团长罗贝特了。这位秃头当初在所罗门神殿狠狠教训了心高气傲的阿泰尔，并杀死了马利克的弟弟。阿泰尔背负着愧疚和压力，第三次来到耶路撒冷，马利克此时的态度已经转变，对待他就像对待兄弟会其他成员一样，表现出了有限度的礼貌和尊敬。这一次，马利克倾尽资源协助阿泰尔，同时也是为弟弟报仇。罗贝特在耶路撒冷是为了参加好友阿丁的葬礼，就是第六个被阿泰尔暗杀的那位。刺杀行动开始前，阿泰尔再次向马利克就所罗门神殿事件道歉，但马利克拒绝了他的道歉，“那个害死我弟弟的兄弟会成员，已经不在了。”他如此说道。
阿泰尔来到墓地，这里正举行着马吉德的葬礼。他远远看到罗贝特的身影，以黑暗为衣，悄无声息地接近了目标。但当他摘下对方的头盔时，他惊讶地发现这是一名女子。原来这个葬礼是个圈套，罗贝特早已料到会有刺客借此行凶。阿泰尔杀掉了伏兵，但放过了被当成诱饵的女人。这个女人告诉他，罗贝特正在阿苏夫集结十字军和撒拉森人，共同对抗他们的新敌人——兄弟会。
后来阿泰尔得知这位美丽的女人叫玛利亚·索普，而他也想不到今后还会与这个女人发生更多故事。
阿泰尔返回马利克处，与他商量到底是继续追击罗贝特还是返回马斯亚夫向慕瓦林报告。马利克建议他去找慕瓦林，但阿泰尔拒绝了，并与之辩论起来。他认为时间紧迫，应提早动身追击罗贝特。
到达阿苏夫后，阿泰尔发现十字军与穆斯林军队的战争已经开始了。他杀出一条血路，来到狮心王理查的帐篷处，惊恐的士兵纷纷拔剑，以防他谋害国王。经过一番辩论，阿泰尔向狮心王告发其追随者罗贝特的背叛，后者当场反驳。理查一时也不知如何是好，决定将权利交给上帝，建议阿泰尔与罗贝特进行决斗，胜者才为真相。
经过一番苦战，阿泰尔击败了罗贝特。在弥留之际，罗贝特向阿泰尔揭示了惊人的真相：原来他的导师慕瓦林，是九个人背后隐藏的第十名圣殿骑士。慕瓦林刺杀九人，实则是为了独占伊甸碎片这件神器，满足自己的私欲，而阿泰尔只是被他利用的一颗棋子。
了解真相之后，阿泰尔准备返回马斯亚夫与导师对峙。而狮心王理查则上前祝贺了阿泰尔的胜利。
理查：看来上帝站在你这一边。
阿泰尔：跟上帝没有关系，只是我是更好的战士。
理查：哈，也许你不信仰他，不过他今天很相信你。在你离开之前，我有个问题，为何你会长途跋涉，只为了杀死一个人？
阿泰尔：因为他威胁了我的兄弟的安全，威胁了我们所维护的一切。
理查：啊，是为了复仇。
阿泰尔：不是复仇，是为了正义，以及可能会到来的和平。
理查：用杀戮换取和平？你不觉得自相矛盾吗？
阿泰尔：也许对有些人讲不通。
理查：没错，比如萨拉丁那个疯子。
阿泰尔：我相信，萨拉丁也想尽早结束战争。
理查：可我没看到任何表示。
阿泰尔：即使他没有表示，人民也希望如此。
理查：人民？他们对此并没有主见，因此才来投靠我们。
阿泰尔：正是因为投靠了你们这种人，才造成如此结果。
理查：哈，胡扯。我们本来就是又踢又叫地来到这个世上，暴力且不安。这是我们的本性，我们不能自已。
阿泰尔：不，我们有权利选择成为什么样的人。
理查：呵，你们这种人，就会玩弄辞藻。
阿泰尔：我所言属实，没有任何诡计。也请当心，您的支持者，并非全都死心塌地的为您服务。
#7.25.更新#
阿泰尔回到马斯亚夫，全村处于一种诡异的氛围中。一位村民上前，用着奇怪的语调拥护慕瓦林，表达自己对慕瓦林的敬仰之情，并号称他找到了通向光明之路。阿泰尔摆脱了这些精神恍惚的百姓，独自上山，却遇到了兄弟会中被洗脑的刺客的阻拦，一场战斗在所难免。他用不危及生命的手段一一把兄弟们打趴下。可当他还未喘息之时，第二波刺客再次杀来。阿泰尔渐渐招架不住，而另一群兄弟从山上和草丛中出现援救，赶跑了受蛊惑的刺客们。阿泰尔定睛一看，原来是马利克。马利克表达了对阿泰尔洞察力的赞赏，以及确认了他所言不虚——慕瓦林利用伊甸碎片：苹果，掌控了整个村子和兄弟会，现在这个阴险的卧底要统治整个圣地。
阿泰尔请求马利克帮助他引开城堡内的刺客兄弟们，以便自己接近慕瓦林。当一切妥当之后，阿泰尔一个人潜入进城堡花园，顿时感到浑身发紧，像被枷锁禁锢住般不得动弹。此时慕瓦林出现在阳台上，手里拿着闪闪发光的伊甸苹果：“这是神的遗产。”
慕瓦林与阿泰尔进行了一番挑衅的对话后，被他杀掉的九个圣殿骑士以幻象的方式复活了。阿泰尔握紧利剑，画出一道道优美的圆弧，辗转腾挪之间杀死了九个幻象。紧接着慕瓦林从阳台上下来，在阿泰尔面前利用苹果再次制造自己的幻影，阿泰尔则利用鹰眼找到了真实的慕瓦林，将其击倒，却发现自己再次被苹果所操控，慕瓦林依旧好端端的在他面前站着。经过一番关于真实和虚幻的辩论之后，慕瓦林开启了苹果的终极力量，顿时天空闪烁，狂风呼啸。可是如今的阿泰尔已不是所罗门神殿时那个轻狂的刺客，他冷静地观察，沉着应对，令自己的内心平静，做出种种准确判断，最终弹出袖剑，刺穿了导师的咽喉。
垂死的慕瓦林绝望地看着苹果从自己手中滑落。“不可能……”他无比错愕地挤出几个字，“学生是不会打败老师的。”阿泰尔令导师安息了。但慕瓦林的话语依旧在天空飘荡：“我专心察明智慧、愚昧与狂妄，却知这是捕风捉影。因为越多智慧，就越多烦扰。增加知识，便是增加忧伤……”
阿泰尔心中五味杂陈，他缓步走向地上的伊甸苹果，即将触碰时，苹果放射出了全息投影，上面映照着世界各地藏有伊甸碎片的地方。慕瓦林的声音再次在空中响起，“毁掉它，阿泰尔。”“我……我不能。”“不，你能，只是你不会。”
此时马利克一行人也来到了城堡庄园，他静静地看着伊甸苹果的投影，对阿泰尔说：“我们做到了。”
一切回归寂静。
戴斯蒙从阿尼玛死中醒来，听到韦迪克和扩音器里的一个声音正在对话，他们对基因记忆中出现的伊甸苹果欣喜不已，并打算依靠其投射出的地图去收集伊甸碎片。扩音器里的声音认为戴斯蒙已经没用了，命令韦迪克杀了他。此时露西再次出面，告诉上层，如果收集碎片途中出了岔子，那么还是有可能需要到戴斯蒙的，这才留住了他的小命。
韦迪克和露西离开大厅之后，戴斯蒙只得回到自己的卧室。突然间，他感到眼睛一阵刺痛，视觉发生了微妙的变化，周围的物体全都黯淡下来，期初他以为自己失明了，直到他把视线移到本应空空如也的墙上。
墙壁上用发光的鲜血画满了各种难以理解的符号，而中央则是一幅硕大的蝴蝶状图案。
戴斯蒙在Animus中呆的时间足够久，引起了出血效应，激发了他体内的先祖基因，令他继承了阿泰尔的鹰眼本领。戴斯蒙不知所措，但更加让他迷惑的，则是这墙上的各种符号和图案。
墙上的各种符号和图案这些，到底是谁留下的？
《刺客信条》作为本系列的开山之作，在当年引起了不小的轰动。育碧首先发行了主机板，虽然游戏有着诸多不足之处，但足够创新的游戏系统，上佳的画面效果，以及引人入胜的剧情，依然得到了不少掌声。《刺客信条》在前一年的E3大展上成为最受欢迎游戏，被认为其开创性可与《波斯王子：时之沙》相媲美。游戏预定量惊人，发售之后的反馈也很不错。这款作品，甚至让育碧摆脱了收购危机——当年它一直是EA的潜在收购目标。
在《刺客信条》中，玩家不仅领略了中世纪圣地及其周边的风土人情，同时也会被细腻的剧情吸引住，就像读到了一首残酷诗歌一样。跟随着戴斯蒙一起参与阿泰尔年轻时的成长经历，其感觉是无与伦比的。因为Animus这种机器的特点，玩家在游戏开篇，便以第一人称的视角介入故事，顺理成章的会认为自己便是主角，这极大地增加了代入感，可谓当年最有意思的设定之一。
那个时候，沙盒游戏还没有现在这么多。《刺客信条》的推出，让人们看到了一种别样的沙盒风格。其背景题材的选取，为游戏中的五张地图赋予了沧桑的历史感。游戏中玩家可以做主线任务，同时也可以选择帮助平民，以及收集宝箱等。跑酷元素很好的继承了《波斯王子》的风格，不过更为写实，取消了飞檐走壁的设定。信仰之跃曾经带给过我视觉冲击力，“面条特效”也令人物更加栩栩如生。不过当2008年育碧发售《刺客信条》PC版时，却遭遇盗版危机，导致销量惨淡。
游戏中的AI也相当出色。兄弟会常常在大庭广众之下刺杀目标，为的是给甜不辣制造恐惧的威慑。而这时，NPC们的反应也被刻画得惟妙惟肖。许多时候，阿泰尔不得不与敌人正面冲突，打击感即使在当年来讲，其实也算不上出色。但是战斗系统第一眼看上去，却更像佐罗那种优雅的风格。对于动作游戏来说，战斗系统的不完美是个不大不小的遗憾，不过《刺客信条》显然把更多的动作要素和开发精力留在跑酷上了。
《刺客信条》所用的新引擎是激动人心的，但整个沙盒世界依然有很多空白可以填补。游戏的支线几乎没有，收集也略显单调，总之就是游戏元素不够丰富。而作为一款刺杀题材的作品，刺杀和潜入环节却做得过于简单无脑，也许真的不能把它归入潜入类游戏吧，它就是一个单纯的开放世界ACT。相信从《分裂细胞》系列来看，育碧并不是没有能力做好潜入，也许是故意的。
总的来说，育碧用《刺客信条》试水的成分更多一些。但即便这样，我们依旧能看出制作组在构架世界观和剧情上面下了大工夫。游戏里的时间不过短短几个月，却让我们看到了阿泰尔从最初的自负，到经受重新的历练和思考，最终遭受导师的背叛，仍可沉着应对。从对信条的肤浅理解，到最后牺牲一切追求真理和正义，重新赢得了兄弟会的接纳，再次成为刺客大师，其成长轨迹令许多玩家动容。这段故事在文本方面，是相当完满的。
本作配乐由Jesper Kyd负责，他突出中东风格，加入大量和声吟唱，为了体现其中的科幻元素，又要兼顾中世纪战争的残酷冷峻，他在古典乐声中加入了电子泛音，点缀紧张感，烘托阴森的气氛。
正因为试水之作，《刺客信条》并未给续集留下太多伏笔。显然阿泰尔的故事还有相当多可挖掘的地方。不过育碧也非常聪明，直到《刺客信条：启示录》中，才再次出现了阿泰尔后半生的经历，这种跨度给系列忠实玩家的情感冲击更为激烈，不过这都是后话了。在《刺客信条》的结尾，我们仍旧不清楚伊甸碎片这种神器到底是什么来历，只知道它在许多历史关键时刻起到了非常重要的作用。而先行者们的登场，则要等到艾叔三部曲了。即便如此，我们仍旧会跟随获得鹰眼能力的戴斯蒙一起发问：墙上那些东西，究竟是谁留下的？
《刺客信条》的故事告一段落了。戴斯蒙为鹰眼所见而困惑。而历史依旧在蹒跚中潜行，从未停止。让我们把日历翻回阿泰尔所处的年代，他的人生还并未结束。
阿泰尔抱着导师的尸体穿过花园，进入城堡，并为他举办了一个简单的葬礼。由于担心伊甸碎片可能会以某种形式令慕瓦林复活，阿泰尔决定火化他。这遭到了一些兄弟会成员的反对，因为刺客一直以来都奉行这对死者尊重的准则。于是，以阿巴斯——当年他的父亲在阿泰尔家愧疚自杀而对他怀恨在心——为首的一批兄弟会成员开始搞分裂。自此，兄弟会变成了两波势力，一方是阿泰尔的追随者，另一方则认为阿泰尔觊觎导师之位，而发动了一场政变。
频繁的暗杀行动开始侵扰阿泰尔。他尝试与阿巴斯进行解释，对方却抱以冷酷回应。阿巴斯还煽动了一些马斯亚夫村民，一起揭竿反抗。当阿泰尔不得不对付那些叛乱的刺客和村民时，阿巴斯偷走了伊甸苹果，苹果在他手里就像魔戒一样，不断地蛊惑阿巴斯的思想，并侵蚀着他的生命。
为了拯救阿巴斯，同时令马斯亚夫恢复平和。阿泰尔最终击倒了他。阿巴斯跪地求饶，阿泰尔则凝视着苹果，思考这件神器能否带给人类理智与和平。之后，阿泰尔恪守信条，不流血的平息了这次事件。他说服兄弟会，艾尔·慕瓦林确实是有罪的。并且向大家保证，在他的领导下，圣地将宁静安稳，兄弟会也会得到健康发展。他的话赢得了黎凡特刺客们的忠诚与信任，最终推举他为新的导师，好基友马利克则成为他的左膀右臂。
#7.26.更新#
拉希德丁·锡南死后一个月，阿芒德·布沙尔代替死去的罗贝特，成为新的圣殿骑士团长。他们深知圣地此时已让兄弟会占了上风，准备逃往塞浦路斯重整旗鼓，因此把守着阿卡港。阿泰尔领导兄弟会筹划进攻此地，在战斗中他又遇到了那个女人——玛利亚·索普。此时的玛利亚被认为保护罗贝特不周，已经遭到骑士团的降级，并被禁止前往塞浦路斯。当她看到阿泰尔时，愤怒交加的她与阿泰尔打了起来。
阿泰尔自然战胜了她，并询问她关于塞浦路斯的信息。然后，他把玛利亚当做人质，准备带她前往塞浦路斯，希望引出圣殿骑士。此刻，睿智内敛的阿泰尔已看出这个女子不像其他圣殿骑士那样阴险狠辣，反而有着善良的内心，只是被甜不辣的理论洗了脑，因此对她有了许多好感，而在玛利亚眼里，阿泰尔只是个冷酷无情的敌人和杀手。
阿泰尔带着玛利亚来到塞浦路斯，在那里与兄弟会接头人亚历山大碰面。玛利亚再次逃走了，并点燃了一个刺客据点。随即她马上跑到阿芒德那里汇报情况，却因几次从刺客手中安然逃脱而引起了阿芒德的怀疑，被囚禁起来。阿泰尔孤身闯入圣殿骑士营地，救出玛利亚。尽管如此，玛利亚依旧破口大骂阿泰尔，并发誓要杀了他。身为刺客导师的他不急不躁，与姑娘耐心地讲道理，并告诉玛利亚，甜不辣要得到的不是自己的头，而是伊甸苹果。
为了追寻逃往凯里尼亚的阿芒德，阿泰尔带着玛利亚登船。在船上他们进行了激烈的辩论，阿泰尔讲述了恩培多克勒的哲学理念，并宣称：“只有自由的思想才能欣赏这个世界无秩序的美。固然，自由可能会带来苦难，但圣殿骑士所追求的秩序则是建立在服从和禁锢之上的，这是更大的苦难。”“人们拥有选择自己命运的权利，即便是坎坷的命运。”玛利亚则反唇相讥，“你现在难道不是在禁锢着我吗？”
刚登岸，阿泰尔便遇到当地海盗的袭击。于是他让玛利亚先爬上梯子，但玛利亚却踢掉梯子，让阿泰尔无路可退，自己逃走了。待阿泰尔终于摆脱海盗追击玛利亚时，却发现她已被当地的反抗组织擒住(只能说，姑娘你时运不济啊)。阿泰尔与该组织领导人马尔克斯取得联系，马尔克斯保证会帮他看住玛利亚。
阿泰尔在凯里尼亚经过几天的调查，锁定了阿芒德的位置。期间玛利亚及反抗组织遭到奸细出卖，被甜不辣追捕，于是阿泰尔救出了反抗组织的一些成员，并寻找玛利亚。在圣希拉里翁城堡中，阿泰尔追寻到了玛利亚，这个城堡是当地总督萨利姆的驻地。阿泰尔扒在窗口附近，窃听到了玛利亚质问萨利姆关于圣殿骑士和伊甸苹果的事情，并质问其到底是想利用苹果统治人类还是自由。萨利姆坚决地告诉玛利亚，凡是阻止圣殿骑士目标和偷取苹果的人，都得死，愚蠢的人类就应该被奴役统治着，否则世界会一直陷入混乱。玛利亚拒绝了这个回答。此时阿泰尔现身，击溃了萨利姆和他的兄弟，玛利亚却再次逃跑。
凯里尼亚的事情告一段落，阿泰尔和马尔克斯在这里结下深厚的友情。随后他返回利马索，继续追查阿芒德。他返回据点，却发现亚历山大已被杀害，伤心之余，一名圣殿骑士的特务领着一群愤怒的民众冲进庭院，并告诉他们阿泰尔是人民的敌人。他劝说无果后，只得使用伊甸苹果，让群众相信圣殿骑士才是敌人。此时这位圣殿骑士继续讽刺挖苦阿泰尔，却突然被一个人跳下杀死了。原来是玛利亚。玛利亚虽然目前仍对阿泰尔所谓的正义持保留态度，但依旧告诉了他阿芒德就在庭院地下的档案馆里。突然一群圣殿骑士追杀了过来，阿泰尔开启无双模式独自战斗，玛利亚则率先逃进档案馆。
在档案馆中，玛利亚被阿芒德击晕。阿泰尔随后赶来，与阿芒德决斗。阿芒德与阿泰尔一样都拥有技艺高超的剑术，一时间打的难解难分。最终阿泰尔洞察到了对方一个微小的破绽，一剑刺穿了阿芒德的胸膛。后者临时前，告诫阿泰尔要保护好伊甸碎片，把它藏起来。
英雄相惜，阿泰尔埋葬了阿芒德。塞浦路斯得到解放，当地的反抗组织出于尊敬，腾出了一个岛给兄弟会建立基地，马尔克斯则成为当地分部的领导。在经历一系列事件之后，玛利亚也对阿泰尔产生了感情，并认同了刺客组织的崇高目标。以上故事均发生于1192年。次年，玛利亚与阿泰尔完婚，见证人是马尔克斯。随后一对新人返回马斯亚夫，马利克表示想死他们了。
正如慕瓦林死前所说，阿泰尔至今没有摧毁苹果。他听从了阿芒德的建议，准备好好保护伊甸碎片。起初，阿泰尔想把苹果封存在利马索的档案馆里，然后又觉得还是自己随身带着比较安心。但苹果的能量一直在侵袭阿泰尔的思想，他越来越多的在深夜着迷地注视着苹果。
在马斯亚夫，阿泰尔把更多的时间用在研究伊甸碎片上，并坚持撰写密函，记录自己的经历。作为导师，他还大幅改革了兄弟会的行事准则和方式。由于圣殿骑士在各地的势力越来越大，阿泰尔遵循“隐秘于每时每刻”，让马斯亚夫的兄弟会转入地下活动。另外，他认为切除无名指的仪式对组织的目的没有任何益处，反倒能让甜不辣更容易发现他们。因此他改良了袖剑，使之不用再切除无名指便可使用，并且开创性的利用毒药增加了袖剑的杀伤力。
袖剑另外，他与马利克还一起发明了一些新的暗杀方法。在研究伊甸碎片期间，阿泰尔发现了一种新奇的金属，这种金属非常强韧，却更轻便，于是他利用这种金属为自己打造了一套铠甲，随后又怕配方落入敌人之手而毁之。因此这套铠甲是独一无二的，在游戏中，经常作为高级隐藏装备让玩家收集。
阿泰尔与玛利亚生了一个儿子叫达里姆。13世纪伊始，阿泰尔开始在世界各地建立刺客分部，壮大组织力量。不过在君士坦丁堡，由于第四次十字军东征的缘故，阿泰尔被迫带领兄弟会撤离此地。
公元1217，已经叱咤亚洲多年的“成吉思汗”铁木真自东方迅速逼近，并计划歼灭所有刺客组织。阿泰尔怀疑此人也有一块伊甸碎片，同时为了保护家园免遭蒙古铁蹄的入侵，他与妻子玛利亚，已成为出色弓箭手的大儿子达里姆启程前往蒙古。二儿子塞夫留下看家，马利克则暂时掌管刺客组织。
在蒙古，阿泰尔一家联系到了当地刺客组织头领高曲兰。他们一同解放了几个被铁木真统治的小行省。在某次行动中，由于阿泰尔年岁已大，不慎被守卫发现，幸亏高曲兰及时出现，拯救了他。而在一系列任务中，达里姆异常出色的表现则令阿泰尔和玛利亚非常欣慰。在蒙古大军进攻西夏时，他们一行人找到了铁木真的营帐，并利用计谋引其现身。铁木真在意识到危险后，准备骑马逃跑，却被高曲兰射中马腿，而远处的达里姆则精准的射穿了铁木真的头颅。此时距阿泰尔离开马斯亚夫，已经过了十年。
1228年，阿泰尔一家返回马斯亚夫，却发现此地已面目全非，兄弟会和自己的家人均陷入到空前的危机中，年迈的阿泰尔被迫面对一场更大的阴谋和邪恶。至于究竟发生了什么，我们留到《刺客信条·启示录》中再做描述。
阿泰尔的故事之所以能流传到现在，威尼斯探险家尼可洛·波罗和费里奥·波罗功不可没。两人于1257年曾来到马斯亚夫，并加入刺客组织，他们在这里听闻了大量阿泰尔的事迹，并把它记录在日记中，随后整理出版，书名叫《秘密圣战》。另外，波罗兄弟还得到了阿泰尔的手札，书籍以及五块马斯亚夫钥匙——记忆封印，并在蒙古大军进攻此地之前逃离，但在返回家乡的途中丢失了手札。1258年，兄弟俩在君士坦丁堡建立了刺客协会，并把阿泰尔的书籍连同五个记忆封印分散埋藏在君士坦丁堡各地的地下墓穴中。1259年，波罗兄弟动身前往东方，开始了长达十年的旅行，希望能从蒙古人手里收回阿泰尔的手札，未果，于是返回威尼斯。1269年，波罗兄弟在意大利威尼斯建立刺客分部，同时将尼可洛的儿子马可·波罗吸纳进组织。1271年，马可·波罗再次前往东方旅行，这回他成功的收回了手札。
(Tips：记忆封印。伊甸碎片的一种，外形铁环状，使用者可把自己的记忆铭记在其中，供后人读取，其所呈现的效果与Animus差不多，也是在意识中形成三维图像，重历记忆的每时每刻。因此也被认为是Animus得以研发出来的技术基础。)
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#7.26.更新#
1296年，意大利刺客、《神曲》的作者但丁招收了一个男孩加入刺客组织，这个男孩叫多梅尼科·奥迪托雷，其父亲是但丁的朋友。
1307年，刺客组织成功控制了法国国王腓力四世，大量圣殿骑士被火刑，时任圣殿骑士团团长的雅克·德·莫莱意识到组织已经无法继续公开存在，因此转入地下，同时让自己故意被捕，并接受火刑，以此来让世人认为圣殿骑士已经解散，但其实他却事先派了九名同党前往世界各地隐藏，准备东山再起。他们有一个响当当的名字：秘密甜不辣！
1321年，但丁被杀害。多梅尼科继承了阿泰尔的手札，并送往西班牙。1324年，马可波罗和多梅尼科的父亲接连被圣殿骑士余党杀害。多梅尼科在蒙特里久尼买下一片庄园，并改造成意大利刺客组织总部。1338年，德国人卢卡斯·楚尔堡加入刺客组织。1348年，秘密甜不辣以“十字兄弟会”的名义在德国向人民提供保护用来抵御鼠疫，卢卡斯则怀疑他们正在寻找永生十字架。两年后，十字兄弟会与卢卡斯均神秘消失。
15世纪初，永乐帝朱棣在圣殿骑士的暗中帮助下登基即位，二十二年后被中国刺客李彤暗杀。1431年，圣女贞德被烧死，圣殿骑士得到伊甸碎片——宝剑。1453年，奥斯曼帝国苏丹穆罕默德二世利用伊甸苹果征服了君士坦丁堡。
1454年，多梅尼科的后裔，刺客乔瓦尼·奥迪托雷搬到佛罗伦萨居住，为美地奇银行工作。其兄弟马里奥·奥迪托雷留守在蒙特里久尼庄园。马里奥在庄园的地下墓穴中意外发现了伊甸碎片——裹尸布，但由于不小心触动机关，造成脸部留下永久性疤痕，并使一只眼睛失明。
1459年6月24日，艾吉奥·奥迪托雷出生。
艾吉奥·奥迪托雷本系列新的宏大篇章开启了。此乃整个故事的巅峰。
让我们如上帝翻书一样，再次轻松地把时钟拨向2012年9月。此时可爱的戴斯蒙还在为墙壁上的图案发愁，露西·斯蒂尔曼却莽撞的跑进来。她命令戴斯蒙赶紧与她一起逃离。搞得呆死萌一头雾水，随后露西把左手无名指弯曲起来，戴斯蒙看懂了这个动作：“WTF？！你是刺客？”
在逃离之前，露西让戴斯蒙再次进入Animus十分钟，为的是搜寻其第二个祖先艾吉奥·奥迪托雷的记忆。很快露西找到了记忆基因段，并重放了艾吉奥出生的那一刻，只见他的父亲，乔瓦尼·奥迪托雷冲进产房，抱起刚出生的婴儿说道：“儿子，开始第一次为生存的战斗吧。”玩家此时需要给婴儿动动手再动动脚，婴儿开始啼哭才算真正接受了这个凶恶的世界。乔瓦尼露出笑容，妻子玛丽亚·奥迪托雷让乔瓦尼起个名字。“佛罗伦萨的艾吉奥·奥迪托雷(Ezio Auditore da Firenze)！”乔瓦尼高兴地说道。
露西让戴斯蒙离开阿尼玛死，并开始逃离阿布斯泰戈。期间戴斯蒙利用得到的鹰眼能力破解了一扇门的密码，令露西大为惊愕。他们随后驱车来到一个废弃的仓库，迎接两人的是现代刺客组织的两名成员：肖恩·海斯汀(Shaun Hastings)和瑞贝卡·柯瑞恩(Rebecca Crane)，肖恩是一名典型的英国宅男，同时也是高超的吐槽能手，他在组织中主要负责数据收集、整理，提供技术支持。早先他并不知道刺客组织和甜不辣的存在，只是单纯的怀疑阿布斯泰戈有不可告人的内幕，于是独自调查，并打算通过维基解密揭露真相。却被阿布斯泰戈绑架，后被瑞贝卡救出，加入刺客组织。瑞贝卡同样也为组织提供技术支持，她和露西是闺蜜，因为露西一直在阿布斯泰戈卧底，她俩已经有七年未见了。同时，她也是Animus 2.0的创造者。
Animus 2.0是椅子型机器，比一代好用两倍，速度更快，也更稳定，并提供保护使用者的装置。同时还可折叠，方便转移，非常适合居无定所的刺客组织。一番寒暄过后，瑞贝卡得到露西从公司偷出来的记忆核心，这样便可让戴斯蒙继续艾吉奥的记忆。很快，他启动阿尼玛死2.0，开始了新的时光之旅。
