然而久旱之后，天作霪雨，昔时地裂的缝隙中不知何故也洪水喷涌，大荒一劫方平又是一劫。帝尧于是启用了鲧来治水，鲧虽然颇有学识，却刚愎自用，固执己见，历经九年治水未果，去天界窃来至宝息壤。诸仙原已不满颛顼时绝仙路、九天裂和后羿射日之事，当下更是大怒，派了火神祝融在卫羽山将鲧诛杀，治水功败垂成，至此大荒和九天的嫌隙愈是加深，连神裔四族因与九天渊源颇深也受到影响。

　　虽则千百年来神裔四族一直秉持教化为主，不涉战事之训，对大荒各部族之间纷争作壁上观，只在魔神烛阴降临时才施以援手。但正所谓“城门失火，殃及池鱼”，颛顼时天崩地裂也使四族所在之天水城、风纪谷、留香寨和落日坡损失惨重，而九天仙界的态度更是让四族齿冷，争论纷纷，有甚者如留香寨采薇堂堂主欢兜，主张不依仗九天之力，研习上古禁忌之毒蛊法以获得更大力量，却与神农氏族人意见不合，自带一批人离开留香寨去了落神山的绝天岭密林中。其他三族同样心灰者众，数百年来，与人族走动也日益减少。

　　帝尧经旱涝两劫，心力憔悴，于是传位给虞舜姚重华，帝舜启用了鲧的儿子大禹重新治水。大禹却意外得到久已不问世事的神裔四族相助，原来自从地隙间涌起阴冷洪水之后，大荒各地显现各种异兆---普通的飞禽走兽变的狂戾无比、凤凰麒麟等灵兽许久未曾出现。而连年水灾，群寇蜂起，异族也趁火打劫。当有人说在绯云关外的涿鹿之野看到了远古九黎氏军队的身影之后，一个可怖的传闻开始悄悄蔓延：明年金星凌日，魔神蚩尤将率领他的混沌军团再次降临大荒……

　　伏羲氏首领天水城城主风少极，察觉到混沌之地隐藏的危险气息。于是召集其他神裔三族的首领们同帝舜一起在天水城秘密会议，之后：

　　天水城与有熊氏白沙村的西海航线重新开通；
    风纪谷最好的斥候被派往绯云关外；
    留香寨尘封已久的天机商团旗标开始在大荒各地出现；
    落日坡内厉兵秣马，一片萧杀之气；
    在帝舜南巡苍梧之野的同时，大禹已经逐步平息了大荒的水患。
    某个月圆之夜，天降流星于涂山氏白狐部族附近，不知昭示凶吉如何。
    金星凌日之际，魔神蚩尤会再次归来吗？所有人暗自捏紧双手，忐忑不安的等待着未知的宿命。