《将军》使用了EAP与Westwood一起开发的3D“战略动作游戏引擎”，简称SAGE，相比《帝王：沙丘之战》单调沙地上奔驰的方纸盒，《将军》的画面进步非凡，达到了当年RTS中的顶级水准。游戏环境包含了大量细节与模拟的物理效果，地形方面沙、雪、草、城市一应俱全，树木随风摇曳，会被车辆碾压倾倒，时不时还有飞鸟穿过，天空中战机在盘旋，地面上可以看到云彩的倒影，河流中水浪朵朵，在某些设定下还会有水位的变化。游戏大量使用了粒子效果，坦克背后总是烟雾腾腾，核弹爆炸的蘑菇云更是当时的硬件杀手。在系统方面，《将军》放弃了C&C传统的基地车-侧边栏模式，选用了业内主流的农民-底边栏系统，总部只负责生产推土机，由推土机将建筑一点点造起来，游戏内拥有大量科技升级系统，可以直接和间接的提升单位战斗力。资源采集方式也从传统的大面积矿区采集型变成了堆积场-补给站搬运模式，这样做可以让资金流变得更加稳定，让游戏变得更可控，同时也为经济单位提供了一个更加安全的工作环境，因此为了保证亘古不变的经济打击战术的有效性，这些搬运工们的脆弱性也是前所未有的。相应的，单位生产方式也抛弃了统筹全局的侧边栏，回到了《沙丘2》时代的在各个工厂内单独选择的形式，而且这次要全额付款，不能再像以前一样依靠资金流提前下单了，作为补偿这次的单位生产速度也大大提高。操作界面的改变引起了很多C&C老玩家的不满，但游戏的战斗风格仍旧是最典型的C&C式的：快节奏、高伤害、大规模。按最初的设定，玩家在进入游戏后可以从3位将军中进行选择，每个将军都拥有自己独特的单位和战术，这也是《将军》这个名字的由来。但在正式版中这个功能被取消了，取而代之的是称为“将军技能”的新特性，玩家在游戏中击杀的每个敌军除了能够将单位升级成老兵外，还能为玩家自身积累将军技能点，这些技能点可以解锁不同的将军技能，包括诸如炮击、A-10攻击这样的杀伤型，伞兵、埋伏之类的补给型，单位升级、侦察机之类的辅助型。这些技能不受具体单位的限制，只要总部尚在就可以直接从地图外召唤进场，这种超越战场的存在同时丰富了游戏的战术、深度和乐趣，成为了此后C&C的标配。单位设定方面，蓝色的美国是传统主角阵营，中规中矩，武器方方正正，科技感十足；中国继承了红色阵营的一贯作风，体系完备的地面力量，拥有双管四履带重型霸王坦克，核子与火焰是他们的标志；GLA作为绿色世界军阀和恐怖组织的集合，使用各种拼凑出来的古旧武器，以高机动和高隐蔽的游击战术见长，但在必要时也能集中兵力发起强攻。
游戏共制作了27个任务，相较以往C&C来说，每方的9个任务难度并不算大。出于对SAGE引擎的自信，游戏不再包含真人过场，剧情的叙述以游戏内的脚本过场与旁白来表现，这种游戏引擎实时运算的动画可以更好的衔接剧情与游戏，但无论如何精细度还是无法和CG相比的。音乐方面游戏也放弃了摇滚乐，风格更为接近汉斯•季默，事实上美国的配乐主旋律就是基本模仿自汉斯•季默的名作《石破惊天》，GLA充满中东风味的配乐则来自《黑鹰坠落》，当时好莱坞还没有多少关于中国的著名电影，因此中国的配乐不得不从传统民歌中汲取营养，在游戏中玩家可以听到诸如《康定情歌》之类的熟悉旋律，辅以笛声等东方元素，再加入一些锣鼓齐鸣的唐人街音乐和充满汉语语调的单位语音，倒也颇有几分别样的中国味道。游戏拥有标准的遭遇战和多人对战模式，遭遇战部分保留了《红色警报2》老少皆宜的精髓，多人模式也以激烈的战斗、丰富的战术广受欢迎，但效率低下且设置繁琐的网络代码仍旧是无法回避的短板，而且EA又选择了GameSpy作为游戏的网络服务商，这简直就是完美的噩梦组合。
毫无疑问，《将军》又是一款经典、精彩而又好玩的C&C，这也多少冲淡了一些Westwood逝去的忧伤，名利双收的EA自然喜笑颜开，快马加鞭催促Mark Skaggs制作资料片，在同年9月就推出了《将军》的资料片《绝命时刻》。《绝命时刻》最大的特点是加入了9个全新的将军，但与原版被取消的将军设定不同的是，这些将军是在进入游戏前选择的，可以说EALA把游戏的可选阵营从3个扩展到了12个！这9个将军都有真人扮演的形象，各自拥有不同的特长与武器偏好，诸如坦克将军的坦克级别更高价格更低还有不一样的帝王坦克等等。游戏内还包含了名为“将军挑战”的单人模式，玩家可以选择一名将军对其他将军发起挑战，在他们的主场体验他们最擅长的战术，而在这个模式的结尾，玩家将面对同时拥有三个阵营武器的终极将军梁玲，完成真正的挑战。不过事实上玩家只能挑战9个将军中的7个，爆破将军的地图只是个隐藏在文件包里的半成品，步兵将军的挑战则根本不存在，由此也可见《绝命时刻》是如何赶工的。游戏也包含了传统的单人战役，每方5个，剧情延续原版，讲述了美国在饱受打击后从欧亚撤退，GLA入侵欧洲，中国横扫恐怖分子的故事。大概是老玩家们对于真人过场的抱怨过于强烈，游戏在任务读取时加入了一段真人出演的新闻报道，制作不算精良，但也聊胜于无吧。多人对战方面，面对12个阵营就不要对平衡性抱什么希望了，由于资料片一系列数据的修改，基础导弹兵成为了游戏的支点，他们是某些将军的支柱，也是某些将军的克星，对他们的任何修改都可能将游戏搅得天翻地覆，于是EAP干脆对此置之不理，不过这一切都不妨碍导弹横飞的《绝命时刻》战场带来的乐趣和竞技性。在Mod方面，《绝命时刻》是继《尤里的复仇》后又一大宝库，并不复杂的INI和自带的地图编辑器开启了无限的可能性，更不用说本已强大而又潜力无限的SAGE引擎了，在10年后的今天，庞大的《绝命时刻》Mod社区依旧保持着自己的活力。
2003年底正逢彼得•杰克逊的《指环王3》上映，EA不失时机的取得了电影的游戏改编权，其中的RTS部分自然交给了Mark Skaggs领导的EALA，并在2004年年底推出了《指环王：中土之战》。游戏仍然使用SAGE引擎，分为正义的刚铎和罗翰、邪恶的埃辛格和魔多四个阵营，通过近40个任务再现《指环王》三部曲中的经典战役。游戏系统上，由于没有C&C名号的羁绊，《中土之战》得以大胆创新，游戏的建筑模式变成了地基式，通过占领地图上散布的地基点进行建筑的生产，依靠生产经济建筑提供资源，还可以为基地升级城墙等防御工事。游戏保留了“将军技能”，顺应流行趋势和电影剧情加入了英雄系统，包含完整的英雄升级、技能释放和复活等元素，单位、英雄与建筑的艺术设定全部沿用电影，电影中的经典人物和兵种悉数登场。单位以小队形式出现，步兵可以列阵，骑兵可以冲击踩踏步兵，而冲击的威力又和骑兵的速度挂钩，飞翔的戒灵能够释放恐惧，将敌军士兵震慑在原地不得动弹，但这个功能并不完善，一个简单的移动命令就可以抵消恐惧的效果。
整体来说《中土之战》还是在水准之上的，特别是在那波持续到07年的《将军》仿制品狂潮中还是彰显了EALA的实力，借助电影的热潮也取得了优秀的市场成绩，Mark Skaggs也达到了个人成就的巅峰，巅峰到有些飘飘然了。在《中土之战》发售后，Mark Skaggs以个人名义向C&C社区发了一封公开信，宣布了下一部作品将是《红色警报3》，而就在玩家们正在震惊的询问《泰伯利亚的黄昏》去哪了的时候，更震惊的事情发生了，Mark Skaggs开始了休假，并在几个月后以家庭原因离开了EA！计划中的《红色警报3》也随之化为浮云。多年后，Mark Skaggs曾在私下表示，当年离开的原因是因为EA只给他9个月来完成这部游戏，这并不是EA第一次提出这样的要求，看看从RA2到《中土之战》的间隔就可以明白，最长不超过15个月，最短只有6个月，之前Westwood也传出过类似的抱怨，对此Mark Skaggs已经感到厌倦了，最终选择了放弃。接替他的是Mike Verdu，参与过《将军》和《中土之战》的高级制作人，他将执掌未来5年内EA的RTS。
新生代
C&C的世界仍旧在沉寂，续作谣言不断，玩家们翘首以盼，就这样进入了2006年，EA推出的却是《指环王：中土之战2》，这一次除了彼得•杰克逊，托尔金老爷子也来了。《中土之战2》与前作相隔15个月，剧情部分聚焦在小说中发生在北地的故事，艺术设定则延续了电影的风格，游戏分为六个阵营，罗翰和刚铎被合并成了人类联盟，保留了魔多和埃辛格，加入了精灵、矮人和地精。游戏战斗系统与前作类似，加入了自定义英雄编辑器，可以抢夺魔戒召唤超级单位，当然还修正了恐惧的Bug。游戏的建筑系统变成了传统的总部-农民式，总部拥有大量附属建筑可供升级，资源建筑仍旧是各种农田肉铺伐木场。游戏使用的还是SAGE引擎，加入了HDR效果，水面也更加柔和。比较而言《中土之战2》更像是上一代的资料片，整体缺乏可陈。当年11月底，仅仅9个月后EALA推出了资料片《巫王的崛起》，事实上这款游戏是外包给BreakAway Games制作的，开发模式类似当年的《沙丘》。游戏的剧情进一步微缩到了那个只能被女人杀死的巫王安格玛身上，讲诉他早年的发家史，并为游戏增加了一个新阵营。大概是由于外包工期过短，原版最后补丁修改的数据并没有写入《巫王的崛起》，将原本接近稳定的游戏平衡毁于一旦。不过这一切都无所谓了，因为在2006年5月，C&C3公布了。
