基本操作
1、武器配置
当我们每次进入关卡之前都会首先进入武器配置房间。在本游戏中单位每回合的行动比如移动、射击都需要消耗ACTION POINTS“行动点数”以下简称AP，用上下键可以调节每个单位携带的副武器和弹药数，但是装备副武器一般都是会减低AP值的。比如侦察兵的无副武器状 态有26AP，不装备副武器的话在战斗中就有26点AP，而如果装备重机枪的话，携带此武器消耗2点AP，弹药每27发还要减1点AP。如果带上54发弹 药的话就一共要消耗4点AP(2+2)那么出击之后每回合星际战士就只有22点AP可供使用了。
2、菜单操作
按SELECT键 可以调出微缩地图，绿色是我军，红色是敌军。黄色是建筑物和掩体，在本游戏中所有的建筑物都可以摧毁，建筑物被攻击到一定程度会变成一堆废墟，在地图上用 灰色显示。这个时候可以当掩体用，调整远程武器可以打到废墟后的敌人，废墟继续受到一定程度的攻击会被完全摧毁，就会变成可以移动的平地。
按START可以调出菜单，有6个选项可以选择
END TURN ：当小队行动完毕时，按此选项结束本回合
SAVE/LOAD/RETRY：存盘/读盘/重新开始
MISSION BRIEFING ：本关胜利条件以及失败条件
HELP ：帮助文件
QUIT ：回主菜单
BACK TO GAME ：回到游戏
3、战斗操作
游戏界面介绍：左边一竖排是你的星际小队，红条是血槽，全空就会死亡，战斗不能。绿条是AP槽也就是行动槽，全空就会本回合行动不能。左下方是选中单位的 数值，左上是主武器弹药无群大的坦克主炮；左下是弹药还剩20发的激光炮；右上表示剩余的AP值；右下是当前的血值。
基本操作
按□可以在主武器和副武器之间随意切换。按 △ 可以蹲下。当然，不是每个兵种都能蹲下，象坦克，无畏机甲这种机械兵种就直接无视了。在掩体上射击后按△蹲下也是比较好用的战术。和传统回合策略游戏不同是游戏没有自由的光标，在游戏中玩家始终处于选中小队队员的状态，而不能象其他游戏一样通过在大地图上操作光标而查看场地信息和敌人的数据。用 L 键切换到上面一个队员，按 R 键切换到下一个队员，在选中队员后马上再按 X 可以多选择一个最近的相同兵种，可以在选中一个侦察兵的情况下再按4次X来选中全部侦察兵，选中后只可以同时移动，不可以同时攻击。选中队员后可以用方向键控制移动范围用 X 键确定就可以进行移动，在地图上每走一格需要消耗1点AP，如果一口气走到红色的箭头的位置话移动后就没有足够的AP来进行攻击。
进攻操作
在移动模式中，把光标移到敌人身上就会自动转变成攻击模式，如果手中装备 的是近战格斗武器的话，光标就会变成一把剑的样子，这个时候按X，你控制的单位就会直接走过去进行近战攻击。而如果你用的是射击武器的话，当光标在敌人身 上就会进入瞄准模式，绿色射线代表理想弹道，如果有障碍物的话，障碍物后的绿线全变黑线表示武器攻击不能。在绿线下还有条黑线是绿线的投影用来让玩家判断 弹道是偏上还是偏下。如果需要直接攻击建筑物的话，按○就可以任意在移动模式和进攻模式之间任意切换。
当确认瞄准好了以后按X决定，会跳出一个小图标，中间的数字表示此次攻击所需要的最少AP值，可以用上下键调整大小。如果瞄准线是绿色表示此线路是理想弹 道，但在随着射程的增加，特别是超出单位警戒范围(单位正前方扇形区域)后远程武器的实际射击效果会有很大偏差造成MISS，下图中绿色瞄准线已经变成红 线，周围的红色扇型区域是本次攻击的弹道的偏转范围。在这种情况下射击的话十有八九是要MISS的，需要按方向键上调高AP消耗量来增加远程武器的精度，如下下图，在把AP消耗调到13之后已经可以99%命中了。注意：无论AP多消耗多少，武器的攻击力也不会多一点点的。另外按方向键左右的话可以切换到射程内的其他攻击目标。
防守操作
这个设定是战锤40000的一大亮点，她打破了传统SLG你打我一回合先，然后我再回敬你一顿的定式。在单位正前方有一块扇形绿色区域，我们暂且称其为 “警戒区域”。在战锤40000里，在对方行动的时候另外一方并不处于完全的“任人宰割”的状态，如果你上回合行动点数有剩余而且足够你使用一次当前武器 的话，如果在对方行动的回合里，对方的单位冲进了你的单位的警戒区域，那么你的这个单位就会自动使用当前装备的武器进行主动攻击，并且AP清0，也就是说 在敌人的回合里每个单位最多只能攻击一次。相反的，在自军攻击的时候，如果冒然冲进敌兵的警戒范围也会被敌人攻击。在行动结束后留点AP活用警戒区域封位 来守株待兔是很实用的打法。
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