在《水晶时代》中，玩家可以按照自己的意愿建造自己的城市，战争会发生在玩家自己建造的城市中，因此城市的类型、风格、功能建筑，都会影响到玩家间的国战。作为玩家的聚集中心，城市对于玩家尤为重要，需要玩家有计划的经营与维护，具备建设类游戏的独特乐趣。

　　在建造初期，玩家只有一个城堡，这也是城市的中心，可以通过它来控制周遭的土

地，这些被控制的土地会被一道道的围墙所分割为若干块大小相同的区域，而玩家想要建造各式建筑只能在这些区域上建筑。三个不同的种族分别有不同类型的建筑，而《水晶时代》的建筑系统的特色在于这些不同建筑的布局与组合。建筑组合的不同会对城市内居民产生不一样的影响。《水晶时代》的建筑系统使得玩家可以根据游戏当前局势的需要来建造建筑，也让这款游戏的可玩性和战略性更上了一个档次。

　　另外，游戏里各个职业更讲求平衡性，互相的制约，相生相克的理念在《水晶时代》里得到了更好的体现。玩家在攻城战的过程中，如果发现对方的作战单位可以克制己方的作战单位，可以立即在据点内建造可以克制对方作战单位的建筑设施，相反对方也会采取这样的招数以求克制住己方生产的作战单位。但是，除了可以这样随心所欲的拆除建筑，不断的更新生产兵种外，建筑的重要性也是玩家要考虑的一个必要因素，在《水晶时代》中，摧毁一座建筑比消灭一队敌人的作用更为显著。