《武林群侠传2》中依然是四大门派相互争斗，所以刚刚起步的玩家需要选择一个门派加入，才可以学习到独门门派心法。
各个门派的特色不同，选择自己喜好的门派加入才可以把游戏的乐趣发挥到极致。
刑天门：为崇拜刑天战神的狂热流派，一生只为追求最高力量。以招招致命的最高伤害为目标，在外功方面的表现相当突出，绝佳的防御能力也是四派之最！在四大门派中，最出色的部分为外功近战攻击以及伤害抵抗能力。
风云谷：崇尚自然之力，武学为循天地万方之道而创。风云谷门派的弟子都能够操纵大自然之力，拥有各种内功的攻击性技能。在四大派中以最强的单体内功及大范围伤害技，尤以秒杀敌人而闻名。
无极医宫：以拯救世人为依归的门派，独特的奇门遁甲及五行之术，能将天地之气理纳为己用，让医宫之人皆拥有救赎世人之心。能自助也能救人是无极最终之道，在队伍中常扮演全队存亡的关键角色，在四派之中拥有最强大的辅助与生存能力。
毒龙教：是以最强暗杀技巧著称的教派，拥有各种诅咒及隐身技巧。作为战场上的无形杀手，技法神乎其技、施毒无踪难防，封印点穴无所不能。在四派之中以暗杀技巧闻名，无论在练级还是在PK均是相当强势的门派。
当玩家角色升到5级时，系统会自动弹出帮助信息，提示玩家可以加入门派，玩家可以点选希望加入的门派，角色会自动寻路到相应的门派分舵处加入门派。如果想以后再加入门派，点选对话框的移除提示即可。
在大都的四个城角，是四大门派分舵的所在地，玩家在角色升级到5级以后，可以在这里找到每个门派的分舵完成入派任务即可加入该门派。
完成好入派任务以后，就可以找门派中的习武NPC，学习门派内功心法了。
