在最新一期的日本游戏杂志FAMITSU上，小岛秀夫透露了一些有关《合金装备3》的最新细节。小岛确认，游戏故事背景确实是在六十年代，而游戏的主题就是在丛林重的生存战。游戏中三分之二的故事发生在野外，丛林、瀑布、洞穴等场景将会是最主要部分。而另外三分之一的故事发生在建筑物中。小岛秀夫认为，这样的设定才能真正表现一款间谍游戏的特点。
E3上《合金装备3》的宣传册原来也暗藏玄机。小岛秀夫指出该小册子背面的小写体字母拼起来就是“big boss”，也就是“合金装备”系列中三位SNAKE的“生父”(solid snake、liquid snake和solidus snake都是用big boss基因再造的超级战士)。当问及本作主角是否snake时，小岛并没有正面回答。不过他透露说《合金装备3》的游戏系统将会与前两作截然不同，尽管没有透露详细情报，不过小岛称，这种改变不仅是在表面上的，整体精髓都会进行大改动。小岛认为这次改动对于国外玩家而言应该会很受欢迎，不过他并不知道玩惯RPG的日本玩家们是否会接受。
小岛透露，在游戏中很多东西都是可以吃的。玩家们可以在环境中到处觅食，另外有些食物比如蛇之类还是可以当作武器的。而敌方的军犬则是不能食用的。当问及是否会因为留下的食物而被敌方发现时，小岛笑着说这还是个秘密。小岛秀夫还指出，他并不打算加入哪些需要新设计操作系统的交通工具，不过在游戏中是肯定会有交通工具可供操作的。他还笑着说，在本次E3展上有很多国外的记者一直问他预告片中的摩托车是否是可操作的，而他就给出了肯定的回答。
在E3展上，《合金装备3》所宣称的就是“回归原点”。小岛称，这是有多层意思的，首先就是来自MGS2中玩家对于雷电作为主角的反映(这意味着该作的主角应该是“回归”到snake了)。另外与MGS2不同的是，该作的的重点是游戏性而不是情节，将会更加注重生存和动作。小岛还暗示，“回归原点”也与“big boss”有关。
MGS3还应用了全新的图形引擎。游戏中人造建筑物等的可破坏程度将会非常之大，而野外场景由于比较复杂实现这一点还比较困难。不过在互动性上已经达到了前所未有的高度，这不仅增加了全新可能性也会给玩家带来不少麻烦。例如从树上或者悬崖上跳下时，主角很可能会把腿摔断。
小岛秀夫拒绝对游戏主题做出评论。不过他确认游戏中将有一个主题把系列三作联系起来，游戏中还将有反战主题。在这一点上，小岛秀夫还举了苏联和阿富汗的例子。另外小岛秀夫向全世界玩家保证说，MGS3将会象前作一样，当玩家们自己玩到该游戏时将会发现巨大的惊喜。当问及《合金装备在线》时，小岛秀夫说该作或许会发售，不过目前还不确定。小岛说他可以现在就立刻发售该游戏，不过该作以目前的情况还是可玩性不高。尽管目前制作网络版MGS已经没有什么技术上的障碍，不过搭建网络基础设备确实麻烦，小岛对于其作为一款产品的价值表示怀疑。小岛还透露MGS3将会对应PS2的宽带网络适配器，使用该功能还将会有一些奖励。例如KONAMI会定期提供一些新的伪装服提供玩家下载等。不过这些主要取决于届时PS2宽带网络适配器的流行程度。
另外在MGS3中，敌方会以四人一个小组进行战术合作，每一位敌兵都会有各自相当高的AI。游戏中还有一些功能可以让玩家不容易被发现，不过会耗费更多的能量，而这样就需要找到更多的食物。小岛秀夫表示，MGS3实际表现将会比预告片更加优秀，游戏将会支持杜比5.1环绕立体声。玩家可以听音辨位不用眼睛也能知道敌兵的位置。目前游戏中还考虑加入即时天气效果。在E3展上配送的手稿就是Metal Gear Rex的原型，另外还有一些交通工具与MGS上息息相关。
