《三国群英传6》的操作方式及基本架构主要继承五代，但更为简化、精进，并且加入大量的浮动式注解，帮助玩家上手。本作新增11个全新兵种，并且赋予所有2阶的升级兵种一个独特的能力，各兵种的特色更加鲜明。

　　武将赋予天生的特殊能力，让三国的人物除了数值、外型的差异外，能够增加更多的个人特色。

　　攻城战全面升级。守方拥有高耸的城墙，还能够透过建物指令，以金钱进行守城军械的建造，从造价低廉的拒马枪，到昂贵却威力强大的元戎神弩，玩家可以依照战略自由建造。攻方借助全新的“冲阵”专用军师技，玩家不仅可以在战前召唤战车、攻城锤等攻城专用的冲阵单位，同时还能够透过“冲阵布置介面”，事先部署各冲阵小队的登场位置。

　　玩家可以在战场上直接用键盘即时控制武将行动，以类似动作游戏的方式进行千人战。