回到船上后是一系列剧情，可以四周走一走调查，去和Joker说话结束序章。

　　章节中：每个章节结束后，都切记要去和自己的队友们说话，你一共有六个队友，三个人有可能打开爱情支线，另外三个人则有特别的支线任务，这些都需要每章后和他们说话来触发。

　　第一章：The Citadel

　　结束了和Udina的交谈后可以自由行动，顺便黑一下他的电脑，可以接到一个支线任务(C-sec警长室的电脑也是)。出门后可以做快捷运输直接去 Citadel塔参加听证会，在塔里会遇到Garrus，他正在试图坚持对Saren的调查。向前走上台阶见到Anderson，进入听证会。听证会当然是失败的，最高议会完全袒护Saren，由于没有决定性的证据，Saren被判无辜。会后Anderson向你建议去情报贩子Shadow

　　Broker的分部去打听情报，还可以去Chora"s

　　Den去找一个名叫Harkin的C-sec警员打听信息。这里开始这个任务就完全是开放性的了，你可以自己决定怎么走，去不同的地方会造成不同的分支，不过最终结果是一样的。你可以先去情报贩子出打听出Wrex的信息，然后去C-sec找Wrex使他加入队伍。然后去Med

　　clinic触发Garrus的剧情。或者你也可以在Citadel四周走走接一下任务，不过建议现在还是不要接太多任务的好，因为主角的Charm/Intim值不够高，很多任务不一定能打出好的报酬。如果你先去Chora‘s

　　Den找Harkin的话会遭到两个Turian杀手的袭击，你完成了Garrus和Wrex的剧情的话，杀手就不会出现了，Harkin也不能再和他对话了，无论怎样做，最后的结果都是主角杀到Chora’s

　　Den找Fist——这个背叛了情报组织，把寻求保护的Quarian人出卖给Saren的家伙。这场战斗的杂兵都很弱，不过和Fist战斗时还是要小心一些，他会放出两个固定炮台助阵，不过他本人很弱。战斗结束后Fist被你(或者Wrex)杀掉，搜索一下屋子然后立刻冲出去救那个Quarian，路上的敌人还是不强，不用担心计时器，目标地点其实很近的，这里会有Turian和Salarian杀手的联合袭击，全灭敌人后和Quarian对话。得知名为Tali的Quarian无意中发现了Saren和Geth勾结的罪证并被四处追杀，主角保护了她，并把证据公布给了最高议会后，Saren终于被定罪了，但是同时也传来了Saren逃走的消息，由于政治原因议会不能触动大规模的军队搜查，于是主角被任命为Spectre特工，专职Saren追击事宜。随后主角得到了新的Talent和更高的Charm/Intim升级段数，可以去做一些支线任务了，比如Asari

　　Consort的任务，如果是Renegade玩家还能看到段床戏。

　　进入C-sec中心的电梯到达港口，Udina和Anderson告诉你三个可以去调查的星球：被Geth突然袭击的Feros；Saren的部下 Benezia建立了研究所的Noveria；以及Benezia的女儿Liara失踪的地点，Therum。这三个地点分别是三个独立的章节，先后顺序完全看玩家高兴，不过个人建议最优先拯救Liara，不仅是因为她是个不错的队友而且有打开爱情支线的可能(太晚去救她的话这条支线就没了)，而且另外两个地点都有一些需要较高等级才能打开的箱子，或者特殊对话等，应该后来再去。

　　第2章

　　第二章：寻找Liara

　　本章一开始会被请求做演讲，有道德加成。进入Liara发掘工作的星系，登陆Therum星球。开始可以熟悉一下Mako这辆车的操纵，前后左右都是右遥杆，左摇杆射击，LT瞄准，按住LT中点击右遥杆是精确瞄准。RT机抢RB大炮。A键是喷射，Y键原地修复，B键下车。向前走一段路，会有Geth飞船降下两只Armature，有Mako在这种敌人不值一提，说实话整个游戏中只要在Mako上，战斗都没有一点挑战性。用喷射可以躲避它们的电浆弹，火炮瞄准两三下了事。继续赶路会遇到三四个炮台守住的基地大门，开掉炮台后门也打不开，回退一段路原来右边有一条小道可以通往基地内部，里面有不少Geth 兵，其中红色的火箭筒兵Juggernaut和Rocket

　　Trooper是新面孔，在Mako上消灭它们很容易，不过平时一定要小心这些东西，被火箭筒直接打中的话可是绝对的九死一生，经测试即使是最硬皮的职业配上最好的甲，最好的被动防御技能，也只能在非最高难度下才能勉强按一炮不死。虽然我没有试过，据说Throw，Lift一类的技能对火箭弹是有效的，有兴趣的人可以试试看。基地的院子里有不少箱子不要忘记去开，两个房子里有开关分别控制两个方向的大门。如果刚才没有把门口的炮台打掉的话就不要把来时的大门打开，否则会死很惨。打开北边的门继续走，前面有不少的 Armature，有Mako在没有问题，直到某个窄口，Mako进不去，必须要步行了。

　　一路上都要十分小心，这里有Geth狙击手出现，不小心被打中的话很惨的，注意它开始用红色的激光瞄准时就躲。如果你是有狙击的类型可以远距离打掉它，不行的话就只能一个个障碍物之间掩护着走了，配合快速冲刺问题倒也不大，继续走可以看到一个上坡方向有一些厂房类型的建筑物。这里请存档！你将会面对第一个有挑战性的Boss战。这场战斗敌人的配合是狙击手/足兵加Stalker，后面还有只Armature压阵，虽然用Mako打它很容易，没有装甲车面对它们却是很恐怖的，电浆弹对你是必杀效果，同时狙击手有干扰技能使你的雷达不起作用(如果武器有相应等级的探测器的话装上就可以反干扰)，Stalker跳来跳去超难打中。理论上尽量用方向键的右键令队友AI去集中攻击这类敌人，AI的准度比较强。主角可以专心打ShockTrooper这些足兵，清光杂兵后专心面对Boss。有 Tech技能的话一定要用上，对它非常有效果。打赢后进入矿井。

　　开矿井门后一层一层往下走，路上会不时有Geth兵出现，直到发现被护罩捆住动弹不得的Liara，调查后发现原来为了抵挡Geth，Liara不得不启动了自己也不熟悉的先贤族护罩，结果虽然挡住了敌人，自己也不能动了。告别她其续走到最底层。启动掘矿用激光(密码AXBY)把地板打通，绕路走到上面帮Liara解开护罩。这里会自动存档，紧接着会有Boss战，一名 Krogan会带着一群Geth来，Krogan不仅血多甲厚，回血也很快。被打倒了还会自动复生一次，换上对生物用弹头比较有效。战斗一开始我方会处在没有掩护的中央，用冲刺快速寻找到掩护是必要的。

　　随后矿脉崩塌，主角一行逃出地洞。在船上讨论总结后本章结束。末尾Joker会询问是否向最高议会报告(每章结尾都会有机会向议会作报告，不要拒绝，在报告中的表现会有道德加成)。