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在第三纪元的最后数年，魔戒之王索伦建立了一支征战大军，中土世界濒临毁灭边缘，在这关键时刻，精灵、矮人和人类的领袖紧急召开了会议，商讨如何抵抗索伦的大军，他们派遣远征队迅速向南摧毁索伦的力量来源，而在北方之地，为了防备索伦的突然袭击则加紧准备着……
邪恶势力
战役一：罗瑞安
北方之战在罗瑞安率先点燃战火，一支来自多尔哥多的哥布林大军驻扎在幽暗森林，并试图攻击居住在魔法森林的精灵，他们通过建造哥布林洞穴、隧道和裂痕来壮大自己的势力，一会儿时间，由哥布林战士、哥布林战士弓箭手、洞穴食人妖和戒灵组成的冲锋部队在索伦之口的带领下向南边发起了袭击，摧毁了河边的两座精灵树屋，但这只是前哨，而精灵堡垒在最南端的卡拉斯加拉顿，哥布林大军继续往南前进，一路上释放出被精灵俘虏的三个高山巨人，尽管遭到了精灵的顽强抵抗，但在高山巨人的协助之下，哥布林大军很快冲进卡拉斯加拉顿，双方在那里展开了激烈的攻防战，数量众多的哥布林大军明显占据着上风，他们很快取得了战斗的胜利，战败的精灵则被赶出了魔法森林，而哥布林大军将继续侵袭整个北方之地。
战役二：灰港岸
受到黑暗魔君索伦的影响，哥布林大军愿意效忠并为其而战，他们朝米斯龙德的古老港口城市灰港岸进发，索伦也派出了昂巴海盗从海上发动攻击，一旦摧毁这座港口，精灵便毫无逃往西方的机会。同时，灰港岸也有着重要的战略意义，索伦能够利用它来为入侵伊利雅德的军队增援。在灰港岸的对岸，索伦的昂巴海盗占领了两座码头，并研造一些战船来阻止精灵的逃离，几艘精灵运输船就在三艘海盗黑船的炮火袭击下葬身于大海，精灵们并不甘心，派遣精灵战舰进行护航，但敌不寡众，依然无法逃离，而占领了前哨的昂巴海盗获得了大量的资源，他们开始研造海盗炮艇来摧毁海滩上的精灵战斗塔。当失去战斗塔后，精灵便再也无法阻止索伦大军的登陆，他们试图利用海滩的地形来阻止索伦大军的前进，但遭到哥布林王葛基尔来自后方的袭击，在前后的夹击之下，精灵部队全军覆没。索伦大军在葛基尔的带领下向东面的灰港岸前进，大势已去的精灵只能眼睁睁地看着他们冲进灰港岸将堡垒摧毁，残存的精灵散乱地躲入山丘，士气正盛的哥布林打算向邻近夏尔的哈比人算老帐。
战役三：夏尔
很久以前，一名哥布林酋长率领一支军队攻入夏尔，捍卫家园的哈比人杀死了酋长并击退了入侵者，哥布林的族人难以忘怀绿地之战的耻辱，如今他们再次踏上这块土地，决心报仇血恨。哈比人有四个权力宝座，只要摧毁这些建筑，就能让他们放弃任何复仇的希望，哥布林王葛基尔带领着他的军队直冲东面的权力宝座，弱小的哈比人无法抵抗他们的进攻，只能看到权力宝座被摧毁。由于地域广阔，葛基尔在东法辛建立了营地，可以随时对军队进行补充。就在这时，登丹人突然出现，他们帮助哈比人保卫家园，还不时地骚扰哥布林的营地，哥布林军队进行调整后马上给予还击，并摧毁了西面的权力宝座，当他们攻击北面的权力宝座时，遇到登丹人的围剿，但在葛基尔的带领下，哥布林军队杀出重围，歼灭了所有登丹人。没有了丹恩人的帮助，哈比人简直不堪一击，葛基尔和他的军队毫不费劲地摧毁了第四个权力宝座。眼看着夏尔即将到手，南方突然杀出一群来自艾辛格的半兽人，同时对夏尔这块土地虎视眈眈的他们，想趁哥布林与登丹人打起来时坐享渔翁之利，毫无防备的哥布林军队被击退了，他们在东法辛重整旗鼓，顶住了半兽人的疯狂进攻，并一鼓作气杀回南部，杀死半兽人的领袖巧言，将半兽人赶出夏尔。经过这场战斗后，哥布林的侵略似乎无法阻挡，哈比人和精灵族已被击挎并溃不成军。
战役四：佛诺斯特
残存的登丹人已集结起来协助蓝山矮人，他们在废墟的佛诺斯特堡垒里建立了一个立足之地，哥布林试图消灭防卫者，并占领这座古老的堡垒做为战利品。佛诺斯特堡垒分为内城和外城，外城只有一个城门，那里聚集了大量的登丹人，葛基尔的哥布林大军并不急于进攻，他们利用高山巨人的投掷石头来摧毁城门和两旁的投石车，城内的登丹人有点急了，频繁从侧面偷袭哥布林的营地，但都无法构成威胁。当城门被打开后，葛基尔一声令下，哥布林大军一窝蜂冲进外城，与登丹人展开了激烈的撕杀，来势汹汹的他们很快占领了外城，并摧毁了外城的所有建筑。这时候，内城里的摧毁性武器大地之槌将在五分钟后发射，它能够给哥布林大军带来致命的打击，葛基尔明显意识到危机的来临，于是带领着他的部队从右面突破，直接杀进内城直捣黄龙，摧毁安置在那里的大地之槌。矮人失去了大地之槌，就相当于没牙的老虎，再也无法给哥布林造成威胁，很快，要塞被摧毁，佛诺斯特沦陷，也打乱了瑞文戴尔的毁灭之日计划。
战役五：幽暗密林
当哥布林蹂躏西边之地时，索伦的军队从多尔多哥向北进入了幽暗密林，旧林路横贯这座巨大的林地，同时也是征服此区域的关键道路，在这座森林里居住的林木精灵在国王瑟兰督伊的领导下，长期守护着这条道路。索伦的半兽人军团在南部整装待发，打算利用桥梁抵达北岸，来到河边时却发现桥梁早已被树人炸毁，但他们的斥候发现东边有条渡河的途径，于是半兽人军团消灭东边的精灵守卫后沿着河流向西前进，一路上顶住岸边树人的攻击，终于在浅滩处上岸。这时，忍耐已久的半兽人军官下令将树人和树人基地烧成灰烬，愤怒的半兽人军团很快将东边的树人基地摧毁。精灵族得知半兽人军团即将到来，立即派遣部队到旧林路占据有利地形，并建造战斗塔进行防御，而半兽人军团也正赶往那里，打算在精灵到来之前抢先占据旧林路，他们在途中遇到了一点麻烦，野外的蜘蛛挡住了去路，多亏蜘蛛王尸罗将它们驯服。当半兽人军团抵达旧林路时，发现这片区域已被精灵占领，他们只好硬闯，通过不断的支援，半兽人军团从精灵手中抢夺了旧林路，并将林木精灵国王瑟兰督伊杀死，经过这场战斗，幽暗密林的精灵纷纷溃散并士气低落，剩余的少数精灵正向西撤往瑞文戴尔，而索伦决定向矮人发动战争。
战役六：凋谢荒地
凋谢荒地的龙群是古老的族类，即使经过了数千年，它们对矮人的恨意丝毫未减，索伦打算与龙族结成同盟来共同对付矮人。矮人非常惧怕龙兽，他们将幼龙囚禁来削弱龙族的力量，释放被困的幼龙是索伦取得龙族信任的最好机会。索伦的半兽人军团来到凋谢荒地后立即向最近的一个矮人基地前进，三只幼龙被困在牢房里，半兽人军团集中力量破坏牢房的大门，将幼龙放出，为了答谢解救之恩，幼龙决定帮助半兽人军团对付附近的矮人，并解救剩余被困的幼龙。尽管一路上遭到矮人的顽强抵抗，但龙兽的力量实在太强，他们很快就摧毁了其他三处的矮人基地，释放了剩余的幼龙。当解救行动结束后，索伦之口得知龙王在西北方的山洞里，于是带着幼龙和残余部队往那里前进。河谷镇民不希望半兽人与龙族结盟，他们守护着通往龙王巢穴的通道，但依然无法阻止索伦之口与龙王的会面。随后，龙王协助索伦之口将矮人困在依鲁伯外，并干掉了他们的国王，矮人的山脉堡垒成为了索伦的战利品，而龙群为索伦而战的时刻也到了。
战役七：依鲁伯
对抗矮人和河谷镇民的最后战争终于到来，若索伦的军队在此获得胜利，那么迷雾山脉以东的地区将在他的统治之下，为此，索伦绝对不能让北方的零散势力有喘息的机会。索伦的半兽人军团来到戴尔河谷城市，他们让攻城部队摧毁城镇的建筑物，然后在废墟中重新建立一个新营地。在重建过程中，矮人不断派遣部队从北面偷袭半兽人营地，索伦之口带领半兽人军团顶住偷袭后，沿着矮人前来的路杀回去。当半兽人主力部队在矿山里与矮人混战时，矮人首领葛罗茵集结了铁丘陵的矮人从西南方向偷袭半兽人营地，但一切都太晚了，半兽人营地招募的新军队同样不可战胜，矮人们的偷袭再次以失败告终。在矿山，半兽人军团越战越勇，直冲王座室，矮人国王丹恩在那里进行最后的抵抗，不幸的是，丹恩很快战死沙场，国王驾崩的消息让矮人们士气大跌，纷纷落荒而逃，半兽人军团乘机将依鲁伯王座摧毁。很久以前，矮人被赶出了摩瑞亚矿坑，现在，他们又被赶出了依鲁伯山脉。
战役八：瑞文戴尔
瑞文戴尔是北方的御宝，这座神圣的城市是中土世界自由民的最后庇护所，索伦想将此古老之地据为所有，根绝自由民的所有希望。现在幸存的人们都聚集在瑞文戴尔，索伦的军队将进攻这座城市，哥布林王葛基尔率先抵达，他们在深谷处设立了营地，而盟军正从西边赶来，急于贪功的葛基尔并不打算继续等待，直接率领哥布林大军从东面杀过去，但不幸落入精灵设置的陷阱之中，哥布林大军见势不妙立即撤回营地，重整旗鼓从西北面继续突破，面对着精灵的战斗塔，哥布林大军寸步难移，残存的登丹人也加入了战斗。正当哥布林大军面临困境时，魔多援军赶到，他们带来的投石车摧毁了瑞文戴尔外围的战斗塔，精灵的防线渐渐被攻破。这时，精灵女王出现了，她的老鹰部队给哥布林大军造成了很大的麻烦，葛基尔也为无法攻击老鹰而苦恼着，在这关键时刻，巫妖王带着堕落妖兽前来支援，堕落妖兽与老鹰在空中互相争斗，而地面部队则在堕落妖兽掩护之下冲进瑞文戴尔。危机关头，甘道夫与亡者军队从东面袭击哥布林营地，而已经进入瑞文戴尔的索伦军队马上赶回来帮忙，当消灭甘道夫后，黑暗魔君索伦也亲自赶到，索伦的所有部队再次冲向瑞文戴尔，摧毁爱隆的房舍。随着自由民领袖的逝去，索伦对北方之地的统治再也没有受到任何抵抗，黑暗降临了整个中土世界。
正义势力
战役一：瑞文戴尔
瑞文戴尔是精灵的藏身避难所和堡垒，到目前为止，这座古老的城市从末受到战火波及，但哥布林开始逼近这座城市，精灵领袖葛罗芬戴兰打算回去向爱隆王汇报情况。在返回途中，葛罗芬戴兰对哥布林如此接近瑞文戴尔感到惊讶，他帮助守卫军击退前来骚扰的哥布林军队，接着进入瑞文戴尔向爱隆王汇报哥布林从南边迫近的消息，而爱隆王早已预感到这一天的到来，他命令葛罗芬戴兰训练更多的战士来抵抗哥布林的入侵。这时，哥布林大军从西边突破，葛罗芬戴兰赶紧带领士兵阻止他们的前进。数量不多的哥布林军队并不能对精灵构成威胁，他们还未进城就遭全灭，而爱隆王女儿亚纹带着长枪兵从西边赶回，她刚去那里摧毁了一座哥布林营地，她还了解到河的对岸还驻扎着更多的哥布林。哥布林的入侵又来了，这次是从南边进攻，愤怒的精灵族决定冲出去与他们决一死战，而来访的矮人领袖葛罗茵也加入了战斗。突如其来的反击令哥布林毫无防备，他们见大势已去，则在营地召唤出一头亚龙来对付精灵，精灵的盟友高山老鹰恰好赶到，他们围攻无法对空的亚龙，将其杀死。在迷雾山脉哥布林的围攻下，瑞文戴尔对精灵来说已不再安全，由于时间紧迫，爱隆王决定联合北边的矮人共同对抗索伦的军队。
战役二：高山隘口
哥布林已占领的高山隘口道路，封锁了东边和西边的重要通道，打算夺回隘口的葛罗芬戴兰和葛罗茵在这里面临他们的第一个挑战。高山隘口是一个危险的地方，安全起见，葛罗芬戴兰决定在继续推进前建造一个营地，一会儿时间，精灵族的各种建筑就耸立在荒芜的冰原上。经过一系列的调整，葛罗芬戴兰带着庞大的精灵军队沿着高山小道前进，他们选择了路途较短的西北方向，但走到半路，冰塔被高山巨人破坏，倒塌的巨冰挡住了前进的道路，葛罗芬戴兰只好带着部队往东北方向另寻出路，一路摧毁了众多哥布林洞穴。根据可靠情报，哈尔达和他的部队被困在北边墙壁，葛罗芬戴兰马上赶过去营救。营救成功后，精灵军队冲进哥布林营地，摧毁战斗塔和各种建筑物，当他们正准备庆祝胜利时，大地突然发生震动，一支看守者从他们脚下钻了出来，给精灵军队造成巨大的伤害，经验丰富的葛罗芬戴兰立即下令全军待命，让弓箭手来对付可恶的看守者。由于哥布林军队从高山隘口追击出来，精灵现在得以越过迷雾山脉，而对抗哥布林的战争仍然在持续着。
战役三：伊顿荒原
古时候，伊顿荒原是安格马巫妖王的家园，现在新的哥布林领袖将此地据为所有，他将执行索伦暴虐意志，一旦击败这位阴险的统治者，哥布林将溃散并陷入混乱，也能够松开索伦对此地区的钳制。葛罗芬戴兰与哈尔达带领着部队来到伊顿荒原，哥布林军队正在进攻精灵屯垦区，而葛罗芬戴兰的部队无法与之抗衡，于是，哈尔达回去搬救军，让葛罗芬戴兰继续前进。葛罗芬戴兰等人沿着山路向精灵屯垦区冲去，并在那里与哥布林周旋，直到哈尔达的援军赶到，他们合力将哥布林赶出了屯垦区，并在此地建立了新的营地。哥布林军队狂暴地穿越山头，如果精灵再不阻止他们的话，瑞文戴尔将再次遭受威胁，而在伊顿荒原的东北面，有座树人森林被哥布林控制着，精灵部队直接过去冲跨哥布林的围困，唤醒沉睡的树人森林。随后，精灵部队向着东南方向的哥布林营地前进，在树人的帮助下，他们很快清除了那块区域，并杀死了哥布林王和摧毁了哥布林堡垒。在战后的余波中，一名孤单的矮人囚犯获得释放，并拼命地恳求葛罗芬戴兰和葛罗茵给予协助，原来蓝山的矮人族正受到龙兽的攻击。
战役四：蓝山
经过长途跋涉，葛罗芬戴兰抵达了蓝山，他们在洞穴入口处发现了一支准备作战的矮人军队，邪恶的龙迫使他们逃出山底下的家园，并在那里作为它的新巢穴。精灵的到来受到了矮人族的欢迎，希望精灵能够协助他们夺回失去的家园。矮人在矿坑外建造营地打算反攻，但遭到龙的袭击，他们不得不躲进矿坑，由于龙的高空飞行能力，矮人无法打伤它，只有在它的巢穴才能够将它杀死。葛罗芬戴兰与矮人们一起将矿坑里的哥布林消灭，并重新建造了一个营地。当时机成熟后，他们从矿坑另一个出口冲了出去，歼灭路上的哥布林，杀进矮人石材加工场，这里也被哥布林所占据，愤怒的矮人下定决心要把哥布林赶出去，一场激烈的战斗在加工场内爆发了，由于地形的缘故，龙无法在高空中飞翔，在葛罗芬戴兰等人帮助下，矮人杀死了龙，并夺回了魔戒，但他们宁愿开采矿山，也不愿加入对抗索伦的行列，失望的葛罗芬戴兰只好前往灰港岸的精灵港口城市，期望精灵会给予较好的答复。
战役五：灰港岸
数千年之后，中土世界的精灵终于开始渡河返回故乡，而灰港岸是他们起程返家的会合点，然而，现在就连这座遥远的城市也无法躲过索伦势力的骚扰，他们派遣昂巴海盗进行封锁和攻击。当葛罗芬戴兰来到灰港岸时，昂巴海盗已占领了南边的港口，他们的海盗黑船在海湾徘徊着，击沉任何试图逃跑的船舰，葛罗茵让他的部下返回蓝山要求矮人前来支援，而葛罗芬戴兰带着精灵军队进入灰港岸，清除在港口骚扰的昂巴海盗。为了突破昂巴海盗的海上封锁，精灵建造了五艘战舰，他们利用战术一举歼灭了所有的海盗黑船，但昂巴海盗并不甘心，仍然在建造新的船舰试图反扑，精灵也不想跟昂巴海盗纠缠下去，让运输船装载两队士兵到南边抢回码头，并摧毁酒馆。这时，号角声突然鸣起，索伦的军队发动了总攻，而支援的矮人部队也正好赶到，索伦的军队先后发动了三次登陆袭击，但终究无法突破矮人与精灵构成的坚固防线，登陆袭击也以失败告终。经过这场战斗，矮人与精灵终于结成了同盟，亚纹和暮星前来协助，同时也带来了一个坏消息，索伦的大军从多尔多哥进入幽暗密林，进攻精灵国王瑟兰督伊的领地，因此葛罗芬戴兰决定东征去协助他们。
战役六：赛尔督因
在英雄骑乘老鹰飞往东方时，索伦的军队从多尔哥多向北前进，抵达了赛尔督因河畔的一处人类屯垦区，依鲁伯附近的爱人在国王丹恩的领导下，前往协助南边人类盟友，在战争开打之前，丹恩送信给林木精灵 国王瑟兰督伊请求协助，在等候精灵援军的同时，矮人必须进行一场险恶的战争。这场战争局势不妙，矮人军队溃散，屯垦区被攻占，前方道路也被切断，但精灵的援军依然还没出现，焦急的丹恩只好带领部队孤军奋战，从远路饶回码头，一路上集结了不少溃散的矮人，经过一场恶战，他们终于抢回了屯垦区，但战斗并未结束，魔多的投石车和猛犸象仍在攻击，士气正旺的矮人冲出屯垦区，渡过浅滩，与魔多军队展开了撕杀，魔多军队甚至召唤出两头亚龙都无法阻挡矮人们的进攻，只能看到他们一步步逼近自己的堡垒，魔多军队只好选择战略性撤退。这场保卫战结束后，矮人使者从幽暗密林带着坏消息回来，由于精灵的家园也陷入危机，他们无法伸出援手，丹恩必须撤回戴尔河谷城市，并在那里建立根据地。
战役七：依鲁伯
来自多尔哥多的大军毫不留情地向北进攻戴尔河谷及依鲁伯，索伦的军队对南边的米那斯提力斯发动攻击，葛罗芬戴兰和葛罗茵抵抗幽暗密林与瑟兰督伊会面，组成精灵与矮人进一步的结盟，而国王丹恩对幽暗密林里举行的会议一无所知，保卫依鲁伯可能是他生命里的最后一战。魔多大军渐渐逼近依鲁伯，丹恩则在戴尔河谷建立防御工事来阻止他们进入高山，在魔多大军到来之前，一支海盗掠夺队在南边试探情况，他们发现丹恩也集结了大量的军队。不久，号角声鸣起，魔多大军发动了第一轮的攻击，两军在戴尔河谷前沿展开了惊天动地的大战，尽管魔多大军数量占优，但却无法突破矮人的防线，他们很快就败退下来，并不甘心的魔多大军派遣战斗食人妖从东面偷袭王座，幸好矮人及时回去才阻止了这次偷袭。随后，魔多大军又发动了第二、第三轮的攻击，但都被矮人抵挡在戴尔河谷外面。当矮人在抵抗猛犸象的突破时，索伦之口发现了高山的秘密入口，他们从那里直接进入高山，对四处破坏，而早有防备的矮人在附近建立了隧道，他们利用隧道迅速回到高山，保护好王座的同时还杀死了索伦之口，前来支援的精灵则继续协助抵抗猛犸象。在精灵的帮助下，依鲁伯的围攻瓦解了，中土世界的阴影一扫而空，但战斗并未结束，精灵与矮人决定捣毁多尔哥多的坑洞，并将黑暗势力赶出北方之地。
战役八：多尔哥多
精灵与矮人的联军正准备袭击多尔哥多的邪恶堡垒，北方之战的最后战争即将开打。根据计划，黄金森林的精灵作为冲锋部队首先来到多尔哥多，他们在那里试探情况，然后发信号通知其他盟友前来。来到多尔哥多后，精灵军队建立了新的营地，并慢慢向东南方向的烽火前进，守在那里的半兽人军队奋死抵抗，但无奈于精灵军队的强大，烽火很快便失守了，等候多时的依鲁伯矮人看到信号后立即往这里赶来，接着，精灵军队马不停蹄赶到西北方向，占领另一个烽火，向幽暗密林的精灵发出信号，他们也在赶来途中。当三军汇合后，便向邪恶堡垒发动最后的攻击，尽管邪恶城堡建造大量的防御塔和炮台，但终究无法抵挡精灵联军潮水般的进攻，他们很快突破了外城，兵分三路，从三条道分别杀向堡垒，连战连败的半兽人军团士气低落到不堪一击，他们甚至在等待奇迹的到来。这时候，魔多的军队也赶往这里，试图挽回败局，但当他们赶到时，堡垒已经被精灵们摧毁了，而他们也被精灵的围剿之下全军覆没。随着索伦军队的战败，凯兰崔尔终于推倒了多尔哥多的城墙，中土世界恢复和平，魔戒战争从此结束。
威力技能使用
每个势力都会有一个威力技能树，玩家通过消耗点数可学到一些威力，它们的作用各式各样，但平衡性不够，一些威力实用性不强，而一些威力则存在BUG或其他问题，学好威力却关系着游戏的胜负，例如召唤士兵的威力必须学的，当敌人攻击你的基地时，你可将他们召唤出来拖延一段时间，或者纯粹增加兵力，以多取胜；而一些被动效果的威力也必须学，因为威力冷却时间实在太长，使用一次后需要等待很久，而被动效果的威力相当于不断在使用。以下介绍几种比较常用的威力及其用法：
号召：目标盟军获得+50%伤害和+50%护甲，多用于近程的士兵
箭矢齐发：对地图上的任何地点齐射箭矢，在初期非常实用，可消灭敌人大量的兵力
召唤汤姆·庞巴迪：召唤一个10级的英雄，虽有时间限制，但用于杀敌已经足够
地震：在一地图造成地震，对建筑物进行破坏，作用范围大，几乎可将敌人营地全部摧毁
覆盖迷雾：迷雾中的友军进入隐匿状态，降低敌人部队护甲和伤害，多用在敌人身上，效果跟号召类似
召唤老鹰盟军：在空中飞翔的巨鹰不容易被打到，对付非远程的敌人效果最好
召唤树人：树人攻击高，但攻击频率低，召唤它多用于拆敌人的炮台或建筑
日光照耀：呼唤一道阳光火柱烤焦战场，威力强大，多用于摧毁敌人的主力
洪水：召唤威力强大的洪水消灭敌人部队，如果敌人原地待命的话，可偷偷使用
矮人财富：选择的建筑物资源产量永久提升300%，初期必学的威力，需频繁使用
弹幕：以压倒性的炮火轰炸目标区域，用于狭窄的山路或桥梁效果最佳
召唤看守者：看守者攻击力强，专门对付敌人的近程士兵，如遇到远程士兵则自取灭亡
龙击：召唤喷火龙腾空飞过并烤焦战场，多用于站位较集中的敌人
召唤龙：召唤喷火龙至战场上，用它可扭转局势。
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